[1]​[2]​ Fue ministro de Hacienda del gobierno del general Juan Antonio Pezet,[3]​ pero solo por cuatro meses pues dicho gobierno finalizó abruptamente con el triunfo de la revolución del coronel Mariano Ignacio Prado, en noviembre de 1865.

[1]​ En 1870, siendo presidente José Balta, fue nombrado ministro de Relaciones Exteriores, integrando el gabinete presidido por Juan Francisco Balta y luego por el general José Allende.

[1]​ Entre 1874 y 1875 editó La Gaceta Judicial, junto con Manuel Atanasio Fuentes, José Antonio Barrenechea, Ramón Ribeyro y Alfredo Gastón.

Poco después, Loayza debió renunciar con su gabinete en pleno.

[1]​[9]​ Finalizada la guerra, se desempeñó como vocal interino de la Corte Suprema (1884-1886), y luego titular.