Durante el periodo de la Segunda República Española ocupó diversos puestos en la administración.

Durante sus primeros años estuvo afiliado al Partido Republicano Radical Socialista (PRRS),[4]​ aunque posteriormente pasaría al Partido Republicano Radical Socialista Independiente (PRRSI)[5]​ y posteriormente se integraría en Izquierda Republicana (IR), convirtiéndose en presidente de IR de la provincia de Alicante.

Desde su nombramiento como director general de Seguridad, Alonso Mallol se centró en intentar combatir la creciente violencia falangista en las calles y la conspiración militar que estaba teniendo lugar.

[12]​[13]​ Para el mes de mayo ya tenía confeccionada una lista de 500 implicados en la conspiración que entregó al presidente Manuel Azaña y al jefe del gobierno, Santiago Casares Quiroga, «con la recomendación de que se procediera a su detención».

[12]​ Pero Azaña y Casares Quiroga no hicieron nada al respecto.

[14]​ A pesar del fuerte operativo policial, Mallol obtuvo un rotundo fracaso y no logró desbaratar los planes golpistas.

[16]​ Mallol regresó a Madrid, convencido de que los rumores sobre una conspiración militar eran exagerados.[17]​[n.