Posteriormente quedó adscrito a la Dirección general de la Guardia Civil.
El historiador Paul Preston señala que en esta época era colaborador del ministro de la Gobernación Rafael Salazar Alonso, y define a Santiago Hodsson como un acérrimo antiizquierdista.
[4] Cuando se produjo el estallido de la Guerra Civil se mantuvo fiel a las órdenes del gobierno republicano, pero su pasado y su papel en la represión durante el llamado Bienio Negro le valieron ser perseguido por elementos izquierdistas.
[5] Cuando Cuba le declaró la guerra a Japón en diciembre de 1941, Santiago Hodsson se puso a las órdenes del Ejército cubano.
[6] En 1945 se trasladó a México, donde se convirtió en Secretario general de información y prensa del gobierno republicano en el exilio.