[3] Como otras especies del género Jenynsia, se caracteriza por presentar un gonopodio tubular formado por los radios anales 3º, 6º y 7º —el cual está asociado con un ducto espermático— y por tener los ejemplares adultos dientes de oclusión tricúspide en la mandíbula.El color del cuerpo es gris-verdoso claro; en los lados muestra 6 a 8 líneas oscuras y finas, o rayas longitudinales punteadas.La hembra no fertilizada tiene un punto anaranjado situado a la derecha o la izquierda de la aleta anal.[2][4] Mediante el análisis filogenético del género Jenynsia basado en caracteres morfológicos, al analizar el ictiólogo Pedro Fasura Amorim en el año 2018 las divisiones taxonómicas dentro del “complejo de especies Jenynsia lineata” utilizando tres métodos diferentes de delimitación de especies, determinó que Jenynsia multidentata es un sinónimo más moderno J.Habita tanto en biotopos de agua dulce como salobre desde climas templado-fríos hasta templado-cálidos.
