Fue presidente del Banco Central de la República Argentina en dos oportunidades por primera vez en 1989 y luego entre 1990 y 1991 durante la presidencia de Carlos Saúl Menem,[1]​[2]​ cargo al que renunció por diferencias con la política económica del gobierno.

[3]​[4]​ Desde 1974 es asesor económico financiero, siendo el presidente y fundador de GF Macroeconomía SA.

En la causa argentina fue investigado González Fraga, cuya consultora GF Macroeconomía asesoró a Pharaon.

[8]​ Según el documento, González Fraga primeramente autorizó que el Banco de Crédito y Comercio Internacional (BCCI) instalara una filial en la Argentina y después que construyera el hotel Hyatt con capitalización de deuda externa.

[10]​ Durante su gestión se desató la hiperinflación argentina de 1990, que tuvo implicancias económicas ya que afectó a todo el sistema productivo y la sociedad;[cita requerida] además del alto endeudamiento externo e interno, estancamiento, escasa inversión en bienes de capital e infraestructura y un grave desequilibrio fiscal;[10]​ se sumó la pérdida del valor de la moneda Austral, llevada cabo por el Banco Central en 1989, cuando estalló una hiperinflación del 3.079 % anual.

[10]​[11]​ En ese momento el país se encontraba sumergido en un proceso hiperinflacionario con un pico del 196,6% en julio.

[10]​ Esto se combinaba con las medidas del plan económico conocido como "BB" que se basaba en acuerdos de precios, privatización de empresas públicas y desregulación económica.

[10]​ Tras ser removido, fue convocado como asesor del ministro de Economía Antonio Erman González.

En el BCRA fue reemplazado por Enrique Folcini, quien estuvo en el cargo apenas dos meses antes dejarle su lugar a Erman González, quien desempeñó simultáneamente el rol de ministro de Economía y presidente del BCRA.

[16]​ y director del Programa de Estudios en Economía Aplicada en la Universidad Católica Argentina.

[4]​ Fue uno de los principales asesores del ex Banco Integrado Departamental con sede en Venado Tuerto.

[17]​Fue socio fundador de la empresa láctea La Salamandra S.A. y su presidente hasta el 2002.

[26]​ En 2019 Javier González Fraga fue denunciado por administración fraudulentas por la operación donde el Banco Nación habría perdido USD 42 millones por un préstamo que le otorgó al ministro Dujovne En febrero de 2019, el BNA conducido por González Fraga le otorgó al gobierno nacional un préstamo con una tasa de interés que se encontraba 450 puntos básicos por debajo de la que ofrecían otros bancos públicos, lo que significó una pérdida de USD 42 millones para el banco.

[37]​ Según la Unidad de información Financiera “tanto estas maniobras fraudulentas como sus instigadores, autores, partícipes y encubridores surgen claramente dado que las gerencias operativas habrían sido instruidas personalmente por González Fraga para beneficiar a la firma, y éste, a su vez, habría sido instruido al respecto por el entonces Presidente de la Nación".

[41]​[42]​En 2017 tras aumentos de tarifas desde 2016 que alcanzaban el 3000 por ciento en algunos casos [43]​relativizó el aumento en el nivel de pobreza y dijo que las subas en las tarifas no afectan tanto a las clases más bajas “porque consumen menos o están colgados.

En la misma entrevista se refirió a las cuentas bancarias en el exterior de Mauricio Macri (principalmente por ser estas en paraísos fiscales) y justificó tal acto diciendo que «tener dinero afuera es casi una necesidad para sobrevivir».