En 1700 acaban los trabajos de ampliación del templo, al añadirle capillas a las naves principales.

En 1728 la iglesia muestra un grave deterioro, realizándose diversos trabajos de reparación que volverán a repetirse en 1739.

Se aprobó la edificación de una nueva iglesia tras declararse la primitiva en ruina total.

Así, en 1755 se encomienda al prestigioso ingeniero militar Francisco Gozar la proyección de una iglesia de mayor dimensiones que la anterior, para ser edificada en La Orotava.

Sin embargo, debido a la demora del proyecto, ya que el 7 de agosto de 1769 el Consejo Real informara sobre el proyecto de Gozar al insigne arquitecto Ventura Rodríguez, es solicitado al maestro Patricio García planificar una nueva iglesia y dirigir las obras.

Se realizó con tanta rapidez que el 11 de diciembre del mismo año el obispo Venegas pudo colocar la primera piedra bajo la puerta oriental.

La construcción del nuevo templo se llevó a cabo entre 1768 y 1778, salvo las cubiertas.

El nuevo edificio se fue levantando simultáneamente en su exterior e interior.

Patricio García tuvo que rendir cuentas el 18 de septiembre de 1775, pues los recursos económicos se veían escasos para continuar las obras al mismo ritmo.

Por ello, se realiza una segunda petición al rey Carlos III.

La Cámara de Castilla acordó la previa rendición de cuentas y más tarde, que la documentación pasase a dictamen del arquitecto mayor Ventura Rodríguez.

Sin embargo, don Ventura no tuvo cuidado al leer el informe de Patricio García, dando la iglesia de La Orotava por apenas iniciada cuando estaba en gran parte conclusa.

Durante esta centuria se adaptó el interior del templo al estilo neoclásico imperante en Europa.

El escultor orotavense Fernando Estévez también llevará a cabo los encargos para renovar la mayor parte de la estatuaria destacando, sobre todo, el grupo escultórico de San Pedro Apóstol (ca.

[15]​ Las hornacinas laterales albergan dos tallas destacadas del escultor Fernando Estévez.

Una talla que refleja el gusto italianizante, principalmente genovés, en la obra del artista villero,[18]​ que ofrece una meticulosidad técnica, sobre todo en el exquisito tallado del cabello.

[19]​ Si bien, el Niño Jesús que porta en sus brazos no responde a este autor.

El retablo de corte neoclásico donde se encuentra la imagen responde al perteneciente al convento dominico de San Benito Abad y que fue instalado en el templo en 1852.

La composición del Altar mayor, de notable estilo Neoclásico, responde a la nueva corriente ilustrada que arraigó con fuerza desde principios de siglo XIX en La Orotava.

Este artista, quién pudo poseer una destacada colaboración en la renovación del templo, también realizó sobre 1823 las dos barandillas del presbiterio, en madera policromada imitando mármol y jaspes.

Al igual que el de la Inmacualada, fue recuperado del templo anterior.

[36]​ Se trata de una obra anónima del siglo XVII,[37]​ donde en el primer cuerpo se sitúa, en una hornacina central, la talla del conocido como el Señor Preso, que representa a Cristo maniatado en su prendimiento, obra atribuida a Blas García Ravelo (1616-1680), del siglo XVII.