A pesar de los limitados medios económicos familiares, recibió una buena educación, haciendo la primaria en Rendsburg.
Luego de confirmarse como aprendiz con el cirujano del regimiento Dr. Möhl, un educado e inteligente profesional que lo introduce en la Medicina y en la Botánica.
Pero había dejado una muy buena impresión al profesor Christian Friis Rottbøll, por lo que lo hace llamar a Copenhague para finalizar su educación y obtener una posición como prosector en la Universidad de Copenhague.
Siguiendo el ejemplo de Vahl, Schumacher se embarca para realizar una expedición internacional en 1784, pero a última hora el derrotero del buque se cambia y no sale más allá del mar Báltico.
Así se ve forzado a cambiar su plan y retornar a Copenhague para ser cirujano del Theatrum Anatomico-Chirurgicum y del Frederiks Hospital.