El programa se centra en los agentes especiales del FBI Fox Mulder (David Duchovny) y Dana Scully (Gillian Anderson) que trabajan en casos relacionados con lo paranormal, llamados expedientes X.Trabajando desde casa, Scully tiene explicaciones científicas para todos ellos, pero Mulder, en la escena del crimen con un atractivo experto en insectos, sospecha que los insectos pueden no ser orgánicos o terrenales.En Miller's Grove, Massachusetts, un exterminador inspecciona el sótano del Dr. Jeff Eckerle, habiendo sido contratado para erradicar una infestación de cucarachas.El exterminador rocía una cucaracha, la tira al suelo e intenta aplastarla bajo los pies.Cuando Eckerle regresa, encuentra el cuerpo del exterminador cubierto de cucarachas.Fox Mulder (David Duchovny) está casualmente cerca, investigando avistamientos de ovnis en Miller's Grove.Mientras habla por teléfono con Dana Scully (Gillian Anderson), el sheriff local, Frass, se acerca a Mulder al que revela que se han llevado a cabo una serie de «ataques de cucarachas» en la ciudad.Cuando intenta capturarla para su análisis, el insecto se desmorona en su mano y las piezas afiladas le cortan los dedos, haciéndole creer que la frágil carcasa estaba hecha de metal.Scully atribuye la muerte del médico forense a un aneurisma cerebral inducido por un exceso de esfuerzo mientras defeca.Mulder luego visita al cercano Dr. Ivanov, un científico en silla de ruedas que trabaja en robots similares a insectos.Los dos discuten la posibilidad de que inteligencias extraterrestres puedan enviar sondas robóticas para estudiar otros planetas.Eckerle le apunta con un arma a Mulder, pensando que incluso él de alguna manera podría ser una cucaracha.Esa noche Mulder escribe su informe sobre el caso, preguntándose cómo reaccionaría la humanidad si unos robots parecidos a insectos visitaran la Tierra.Mulder encuentra un bicho de aspecto extraño en su comida, y lo aplasta con un expediente X.Entertainment Weekly le dio a «War of the Coprophages» una A- y escribió: «Un campamento irreverente que está infestado de risas (y bichos raros) pero tira la credibilidad por la ventana».Club le dio al episodio una A y lo comparó con «Clyde Bruckman's Final Repose» escrito previamente por Morgan, escribiendo: «¡Entonces![...] La comedia aquí puede ser amplia, pero siempre hay suficientes comentarios autoconscientes enterrados en ella que nunca se vuelven simplistas.Sería mejor creer en un montón de bichos del espacio exterior que vienen a la tierra para jugar con nuestras mentes, que aceptar la verdad más probable de que a los bichos les gusta la mierda, y por aquí, siempre hay mucho para todos».[15] El autor Phil Farrand calificó el episodio como su segundo episodio favorito de las primeras cuatro temporadas en su libro The Nitpickers Guide to the X-Files.
Debbie Cove, la entrenadora de animales de
The X-Files
, utilizó alrededor de trescientas cucarachas para este episodio, de las cuales solo una murió durante la producción (debido a su vejez).
