El Gran Premio de Japón de Motociclismo de 2003 fue la primera prueba del Campeonato del Mundo de Motociclismo de 2003.

Tuvo lugar en el fin de semana del 4 al 6 de abril de 2003 en el Circuito de Suzuka, situado en Suzuka, Prefectura de Mie, Japón.

La carrera de MotoGP fue ganada por Valentino Rossi, seguido de Max Biaggi y Loris Capirossi.

Manuel Poggiali ganó la prueba de 250 cc, por delante de Hiroshi Aoyama y Yuki Takahashi.

La carrera de 125 cc fue ganada por Stefano Perugini, Mirko Giansanti fue segundo y Steve Jenkner tercero.