El tema de su disertación fueron ecuaciones diferenciales parciales no lineales (Reguläre Kapillarflächen in negativen Gravitationsfeldern).
En 2002, Huisken se convirtió en director del Instituto Max Planck de Física Gravitacional (Instituto Albert Einstein) en Potsdam y, al mismo tiempo, profesor honorario en la Universidad Libre de Berlín.
Sigue siendo un miembro científico externo del Instituto Max Planck de Física Gravitacional.
El trabajo de Huisken está en la intersección del análisis, la geometría y la física.
Gerhard Huisken ha hecho importantes contribuciones a la relatividad general.