Ganekogorta es una montaña vizcaína situada al sur de Bilbao, en el País Vasco, España.
El Ganekogorta es la cima más alta del sistema montañoso del sur de Bilbao y se ubica en el término municipal de Alonsótegui.
La cima principal está constituida por un cresterio cuya cara norte presenta vegetación rasa y tiene una fuerte pendiente que desciende hacia el núcleo urbano de Alonsótegui, mientras que la cara sur es un barranco rocoso que termina en los valles de Oquendo y Zollo.
La frontera con Álava está a unos 10 m del vértice geodésico de la cima principal.
Una vez allí, se toma la pista forestal rumbo al sur hasta llegar al collado de Muñagane, donde el camino se bifurca: un sendero inicia la ascensión al Ganekogorta y el otro bordea la cresta por la cara sur y enlaza con Zollo y la ladera alavesa.