En el ser humano se conoce una isozima de esta proteína (PDE9A) y dieciséis isoformas.

Como cofactor utiliza dos cationes metálicos divalentes por subunidad cuyos sitios de unión se encuentra en el dominio catalítico.

La isoforma PDE9A1 se localiza en el aparato de Golgi y en el retículo enplasmático.

La enzima se expresa en muchos tejidos (testículos, cerebro, intestino delgado, músculo esquelético, corazón, pulmones, timo, bazo, placenta, riñón, hígado, páncreas, ovarios y próstata) excepto en la sangre.

Los mayores niveles de expresión se dan en el cerebro, riñón, bazo, próstata y colon.