La nucleótido cíclico fosfodiesterasa es un tipo de enzima fosfodiesterasa que cataliza la hidrólisis del enlace fosfato interno de un nucleótido monofosfato cíclico.

Según la numeración EC del Comité de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology NC-IUBMB) estas enzimas se encuentran clasificadas dentro de los números EC 3.1.4.--.

La 3',5'-nucleótido cíclico fosfodiesterasa, o cAMP fosfodiesterasa, o simplemente fosfodiesterasa (EC 3.1.4.17) es una enzima que cataliza la reacción: Esta enzima actúa sobre los siguientes sustratos: Hasta el momento se conoce que el ser humano posee 8 genes que sintetizan esta enzima.

La 2',3'-nucleótido cíclico 3'-fosfodiesterasa o cCMP fosfodiesterasa (EC 3.1.4.37) es una enzima que cataliza la reacción: La fosfodiesterasa específica del guanilato cíclico o fosfodiesterasa A1 (EC 3.1.4.52) es una enzima que cataliza la reacción: Esta enzima utiliza como cofactores el grupo hemo, magnesio y manganeso, y es inhibida por Ca2+ y Zn2+.

El equilibrio entre estas dos enzimas determina el nivel celular del di-3',5'-guanilato cíclico.