Seguiría en el Open by Nissan durante dos años más, aunque sin el presupuesto necesario para disputar temporadas enteras.
En 2002 el Open by Nissan se dividiría en dos categorías, siendo la Fórmula Nissan 2000 la más nacional, para competir en ella, el Circuito de Albacete creó una escudería que duraría 5 rondas en activo y en la que Fernando pudo competir junto a su compañero de equipo Pedro Muñoz.
Decidió el siguiente año pasarse a la Renault Clio Cup Española, donde estuvo tres temporadas protagonizando grandes duelos junto a los mejores pilotos "coperos" de esos años, siendo subcampeón, tercero y finalmente campeón de esta copa en 2007.
Tras un pequeño descanso en 2008 con apariciones en algunos rallyes,[2] en 2009 se apuntó a la Copa Peugeot 207,[3] donde fue subcampeón esa temporada pero que acabaría ganando en 2011, ya dentro del CER y compartiendo coche con Gonzalo Martín de Andrés.
[12] En 2023 reaparecería en el GT Cup Open para disputar la temporada entera con el italiano Stefano Bozzoni a bordo de un Ferrari 488.