Ante ella presentó su renuncia el presidente provisorio del Perú, Luis José de Orbegoso, que no fue aceptada, quedando momentáneamente como presidente provisorio del Estado Nor-Peruano.

Cabe señalar que esas tres asambleas tuvieron un carácter improvisado, fueron poco representativas y se desarrollaron bajo el influjo autoritario de Santa Cruz.

Pero la guerra desatada por Chile y los emigrados peruanos contra la Confederación impidieron la reunión de esa nueva asamblea.

El Estado Nor-Peruano estaba subdividido en cuatro departamentos: En 1836 se creó (o para ser más exactos, se recreó) el departamento de Huaylas, con capital en Huaraz, que años después cambiaría su nombre por el de Áncash.

Su período de gobierno se fijó en diez años, pudiendo ser reelegido indefinidamente.

Este Congreso General quedó solo en proyecto y nunca se reunió, por motivo de la guerra desatada por Chile.

Si bien no se definió mediante la carta fundamental del estado, ni las características ni las atribuciones del poder judicial, en la práctica este estaba representada por cuatro cortes de justicia.

El gobierno chileno desconoció el Tratado de Paucarpata y partió de Valparaíso una segunda Expedición Restauradora, apoyada igualmente por los emigrados peruanos, encabezados esta vez por Agustín Gamarra.

Esta expedición desembarcó en Ancón, es decir en territorio del Estado Nor-Peruano donde la causa de la confederación no tenía tanta popularidad como en el sur.

Santa Cruz nombró como nuevo presidente provisorio del Estado Nor-Peruano al mariscal José de la Riva-Agüero.

Santa Cruz huyó apresuradamente hacia Lima y de allí partió al destierro.