Hasta 1956 sirvió como estación de empalme con el ferrocarril Pamplona-Sangüesa —conocido popularmente como «El Irati»—, que accedía para combinar el transporte de viajeros y mercancías entre ambos ferrocarriles.
El actual edificio para viajeros es una amplia estructura de dos plantas y base rectangular con disposición lateral a las vías.
El tráfico de Larga Distancia que tiene parada en la estación incluye principalmente relaciones transversales realizadas con trenes Alvia que unen Barcelona con Asturias, Galicia y el País Vasco pasando por Castilla y León.
Madrid también está unida con la ciudad gracias a otro Alvia que cubre el trayecto Madrid-Pamplona.
El tráfico de Media Distancia con parada en la estación tiene como principales destinos Zaragoza, Castejón y Logroño.