En su patronado están representadas las principales empresas del sector público ferroviario español y tiene encomendada la recuperación, custodia, generación y difusión del patrimonio histórico, cultural, científico y tecnológico del ferrocarril en España, con voluntad de colaboración sectorial.

Este Palacio es uno de los edificios decimonónicos más valiosos y que mejor se conservan en pleno centro de Madrid, situado en el triángulo formado por el Museo Nacional del Prado, el Museo Thyssen-Bornemisza y el Museo Nacional Centro de Arte Reina Sofía.

Desde el año 2000 mantiene activo el portal www.vialibre.org que diriamente emite boletines informativos.

Además desarrolla otras actividades como: "Arte en Palacio", exposiciones de arte contemporáneo en el Palacio de Fernán Núñez; “Arte sobre raíles”, colección compuesta por más de 200 obras relacionadas con el ferrocarril con las que se realizan exposiciones; "¡Próxima Estación: Música!

El Museo del Ferrocarril de Madrid se abrió al público en 1984.

Su sede es la antigua estación de Delicias y ofrece una selección de vehículos y piezas relacionadas con el ferrocarril, que pretende mostrar su evolución diacrónica.

En su Catálogo de Publicaciones se pueden ver todas las disponibles actualmente.