El kilometraje se corresponde con el empleado por la antigua línea Linares-Puente Genil, hoy desmantelada en su casi totalidad.La construcción del trazado entre Linares y Puente Genil no se completó hasta enero de 1893,[3][4] tras lo cual se posibilitó el enlace de Jaén con importantes municipios como Torredonjimeno, Torredelcampo o Martos.[6] Para ello, se habilitó una vía de apartadero que permitiera el enlace ferroviario.Con ello, Jaén perdió así su histórica conexión con la Subbética y la línea a Málaga.Además, en 1988 se clausuró y derribó la histórica estación de «Andaluces».
Un tren de Media Distancia estacionado en Jaén (2011).