El espacio químico es un concepto en quimioinformática que se refiere al espacio que abarcan todas las posibles moléculas y compuestos químicos que se adhieren a un juego dado de principios de construcción y condiciones a la frontera.[2] Un espacio químico usualmente referido en quimioinformática es el de las moléculas farmacológicas potencialmente activas.La estimación restringe también los elementos químicos usados a carbono, hidrógeno, oxígeno, nitrógeno y azufre.Este número usualmente es malinterpretado en publicaciones posteriores que lo confunden con el tamaño estimado de todo el espacio químico de las moléculas orgánicas,[4] el cual sería mucho mayor al incluir a los halógenos y otros elementos.Para julio de 2009, existían 49,037,297 sustancias orgánicas e inorgánicas registradas en el Chemical Abstracts Service (CAS), indicando que se habían reporado en la literatura científica.