[1] Asistió a la escuela de Alcuéscar (Cáceres), donde vivió toda su infancia para posteriormente estudiar bachillerato en Badajoz.
En el año de 1907 la Real Sociedad Española de Historia Natural le designó para acompañar a Salvador Calderón y Arana en una expedición a las Islas Canarias orientales.
Además, durante su larga vida, desempeñó otros cargos en numerosos organismos científicos.
Es por esta obra que Hernández-Pacheco puede ser considerado aún hoy el padre de la geología española.
Su producción científica fue muy extensa, abarcando temas de geología, paleontología, geomorfología, prehistoria o conservación del patrimonio natural.