Domingo se casó en dos ocasiones, y tiene dos hijos del primer matrimonio.
Huyeron a Suiza, luego se refugiaron en Argentina e Italia y por último en Estados Unidos, donde reside.
Actualmente, Domingo de Habsburgo administra el castillo transilvano desde su residencia en Nueva York.
Algunos carlistas octavistas también reconocieron a su padre el Archiduque Antonio como "Carlos IX" hasta su definitiva renuncia en 1961.
El testigo fue recogido por otro hermano, Francisco José, fallecido en 1975.