La sede original de la diócesis era Seir-Kieran, aunque al igual que el resto de las antiguas sedes monásticas en Irlanda, la jurisdicción era más tribal que territorial.En la última década del siglo XII la catedral se trasladó de Aghaboe a Kilkenny.Sin embargo, la crisis se abrió durante el reinado de Isabel I de Inglaterra y desde entonces la diócesis estuvo a menudo vacante durante largos períodos.Se produjo un renacimiento más completo de la diócesis con el obispo William Kinsella, quien construyó o reconstruyó numerosas iglesias parroquiales y fundó la universidad de St Kieran en Kilkenny, con un seminario adjunto.En 1994 el seminario diocesano del colegio de San Kieran fue cerrado.
Catedral de San Canicio, en Kilkenny, que desde el siglo
XVI
pertenece a la Iglesia de Irlanda