[2] El Instituto se vincula con el presidente de la República a través del Ministerio del Deporte y puede utilizar, para todos los efectos legales y contractuales, la denominación "Chiledeportes".
Desde 2014, su director Nacional es nombrado a través del sistema de Alta Dirección Pública.
En estas reuniones se discutieron los problemas existentes, y cuales podrían ser las soluciones.
La selección de los proyectos a ser financiados con recursos del FONDEPORTE se efectuará anualmente mediante concurso público convocado por el IND.
Postulan principalmente a este concurso instituciones deportivas que están inscritas en el IND.
Para que una institución deportiva pueda acceder a este subsidio, deberá tener una cuenta de ahorro, en donde tenga dinero ahorrado para la compra o construcción del recinto deportivo.
Tras la denuncia de esta irregularidad, la página web del gobierno fue modificada.
La Presidenta Michelle Bachelet ofreció en ese momento el cargo a Aldo Schiappacasse, quien lo rechazó, por lo que Depassier fue reemplazada interinamente por Ernesto Moreno.
Sin embargo, su renuncia se le asocia a cuestionamientos de proyectos presentados en 2005 y 2006 por el organismo "Chile Volei", que él presidía y que presentaban anomalías.
Es reemplazado por Jaime Pizarro, exfutbolista y profesor de educación física.
En octubre de 2006 se descubrieron muchas irregularidades en los proyectos financiados por el IND.
[9] La misión de este cargo sería proponer las bases para la creación del nuevo Ministerio.