En ella participan los equipos de Andalucía Oriental y Melilla.
En la temporada 1993-94 se recuperó la Copa Federación, por lo que el formato del torneo cambió y se instauró una fase regional antes de una nacional.
A esta fase regional se accede mediante inscripción voluntaria entre los equipos que no jueguen la Copa del Rey.
La Copa RFEF actual, no es considerada por la RFEF como la original, que se disputó entre los años 1944 y 1953, solo jugándose en la última edición una fase clasificaría mediante una liguilla, que comprendía a toda Andalucía que fue ganada por el Xerez Club Deportivo.
A partir del invierno de 2020, se crea la Copa RFAF.