[3] Los productos farmacéuticos y agroquímicos habitualmente contienen sólo un átomo de flúor o un grupo trifluorometilo.Los compuestos perfluorados son derivados fluorados, que están estrechamente relacionados estructuralmente con los fluorocarbonos.Sin embargo, también poseen otros átomos distintos de carbono y flúor, tales como nitrógeno, yodo, o grupos iónicos, como por ejemplo los ácidos carboxílicos perfluorados.Por lo tanto, el único punto sobresaliente de todos los compuestos organofluorados es que el enlace carbono-flúor puede alterar las propiedades biológicas[6] Mientras que tanto el uracilo y el 5-fluorouracilo son sólidos cristalinos incoloros, con puntos de fusión elevados, el derivado organofluorado es un potente medicamento contra el cáncer.Del mismo modo, el fluoroacetato es un potente veneno natural, mientras que el ácido acético diluido en el agua es vinagre.Se han encontrado organofluorados biológicamente sintetizados en microorganismos y en plantas, pero no en animales.[5] Entre los ejemplos se incluyen el 5-fluorouracilo, la fluoxetina (Prozac), la paroxetina (Paxil), el ciprofloxacino (Cipro), la mefloquina y el fluconazol Algunos procesos abióticos también pueden generar compuestos organofluorados considerados como "moléculas problema".[4] Sin embargo, muchos organofluorados se enfrentan a problemas ambientales y de salud.
Cargas parciales en el enlace C-F debido a la polaridad del enlace