Debido a las concesiones que otorgara el gobierno liberal del general Justo Rufino Barrios a finales del siglo xix hubo una segunda colonización de la región, esta vez por parte de familias alemanas como los Diesseldorf, Thomae y Sapper, entre otros, quienes se dedicaron al cultivo de café a gran escala.

Sigue siendo un enigma a que entidad política se refería el término Cobán.

Sin embargo uno de los argumentos con mejor sustento científico es el basado en los estudios recientes del antropólogo neerlandés Ruud Van Akkeren.

El municipio alberga un total de 551 incluidos aldeas, asentamientos, colonias, fincas y ciudad .

Debido a que su terreno es kárstico en su mayoría, su topografía es variada, con montañas y simas o siguanes que sobrepasan los 1000 m de elevación y los 100 m de profundidad respectivamente; las tierras bajas descienden hasta unos 300 metros sobre el nivel del mar en el área norte.

[17]​ Las Casas, junto con otros frailes como Pedro de Angulo y Rodrigo de Ladrada, buscó a cuatro indios cristianos y les enseñó cánticos cristianos donde se explicaban cuestiones básicas del Evangelio.

Tras dos años de esfuerzo el sistema de reducción comenzó a tener un éxito relativo, pues los indígenas se trasladaron a terrenos más accesibles y se fundaron localidades al modo español.

[24]​ Específicamente en la Verapaz, la doctrina abarcaba los pobladres de Cahabón, Cobán, Chamelco, San Cristóbal y Tactic.

[25]​ En 1765 se publicaron las reformas borbónicas de la Corona española, que pretendían recuperar el poder real sobre las colonias y aumentar la recaudación fiscal.

De tal modo, se puede evidenciar cómo esta región hay estado en un aislamiento desde su fundación.

En la segunda mitad del siglo xix, el presidente Justo Rufino Barrios (1835-1885) comenzó la adjudicación de tierras de la Verapaz a agricultores alemanes;[40]​ los alemanes establecieron una colonia en Alta Verapaz gracias a generosas concesiones otorgadas también por los presidentes liberales Manuel Lisandro Barillas Bercián, José María Reyna Barrios y Manuel Estrada Cabrera.

[41]​ La inmigración alemana en Guatemala empezó con Heinrich Rudolf Dieseldorff (Rodolfo Dieseldorff), en 1863; tras él vinieron grupos de inmigrantes alemanes eran en su mayoría jóvenes que aprendieron el idioma q'eqchi', y varios de ellos se mezclaron con algunas mujeres indígenas.

En Cobán, se centró una gran comunidad de alemanes que llegaron a dominar las tierras del cultivo del café, donde a sus trabajadores pagaban con monedas acuñadas por cada propietario, además que sólo podían comprar en la despensa de la finca, con lo cual el patrono obtenía una segura ganancia extra.

[40]​ Desde esta época, la principal actividad económica fue la agroexportadora, especialmente de café, banano y cardamomo.

[43]​ La propiedad comunal, dedicada a cultivos de subsistencia y que había sido conservada por el gobierno del general Rafael Carrera, se convirtió en propiedad privada dirigida al cultivo y comercialización a gran escala de productos agrarios.

El lugar fue remodelado y equipado para dar un ambiente agradable, donde los alemanes se sintieran como en su país.

El historiador guatemalteco Francis Polo Sifontes cuenta que durante la Segunda Guerra Mundial muchos alemanes fueron llamados para prestar servicio militar en su país.

En 1905 Nottebohm emigró a Guatemala y se estableció en dicho país como comerciante, adquiriendo diversas propiedades con el paso de los años, no obstante Nottebohm a lo largo de los años mantuvo contactos con Alemania en razón a que sus familiares directos aún vivían allí, además de mantener relaciones comerciales con diversas firmas germanas.

No obstante las autoridades guatemaltecas replicaron de inmediato al cónsul suizo afirmando "no reconocer que el Sr. Nottebohm, nacional alemán domiciliado en Guatemala, haya adquirido la nacionalidad de Liechtenstein sin cambiar su domicilio habitual".

La región quedó en un parcial abandono hasta 2008, que se inició la construcción de la carretera en la franja.

El municipio de Cobán se encuentra localizado en la parte central del país, que es una región en la que crece café estrictamente duro, y es el mayor productor y exportador de cardamomo del mundo.

[57]​ A partir de 1990, Max Quirín Schöder había destacado en el mundo empresarial cafetalero; sus negocios y fincas se concentran en la Empresa Comercial Agrícola, S.A. (ECOAGRO) con sede en Cobán.

Entre otras industrias destacan las artesanías como los tejidos, trabajos de madera y platería.

La ciudad ha demostrado un desarrollo económico en aumento en donde ya se observan inversiones en infraestructura, productos de valor agregado y energía.

[61]​ Los inversionistas en palma africana ampliaron sus plantaciones desde la costa sur hacia el norte del país, adquiriendo tierras en la Franja Transversal del Norte y Petén; para 2014 se estimó que el área sembrada de palma africana tenía una extensión de ciento treinta mil hectáreas.

[62]​ El proyecto se fundó exclusivamente para la producción de agrodiésel de palma, el cual se vendería como materia prima bajo contrato a Green Earth Fuels (GEF) para su procesamiento y posterior transformación en plantas en los Estados Unidos.

Pero en 2010 Arriola Fuxet se retiró como socio quedando la empresa completamente en manos de estadounidenses.

En la iglesia se venera al Cristo del Calvario, imagen esculpida por Quino Cataño.

Fue escrita por Domingo Bethancourt, la letra es la siguiente: En Cobán yo disfruté del encanto de su suelo, las bellezas que admiré motivaron esta canción.

[71]​ Cobán ha sido destacado en el baloncesto y ha tenido las mejores escuelas para menores en este deporte; en varias ocasiones se ha coronado campeón nacional.