El origen del nombre de Chamartín no se conoce con seguridad.

También se ha propuesto como explicación una corrupción de San Martín en Chan-Martín, aunque esta última hipótesis tiene la dificultad de que el patrón del pueblo, así como del actual barrio, es San Miguel.

[cita requerida] Sabiendo que formaba parte del sexmo de Vallecas, y que aparece en la Edad Media repoblado por vascones, el cha podría venir del euskera hablado por los primeros habitantes: etxe.

De este modo, nos encontraríamos con un simple antropo-topónimo, tan común en la toponimia tanto local como universal: "(la aldea o quinta del señor) Echa Martín".

Los orígenes medievales son oscuros y no se sabe casi nada, aunque por una de las etimologías de Chamartín (cha- podría ser aita = padre), podríamos aventurar que fuera fundada por vascones o quizá navarros en el s. XI.

Alcanzó los 800 a comienzos del siglo XX y se comunicó con la capital a través de un tranvía (subiendo por la Castellana, y sirviendo así también al barrio de Tetuán).

[2]​ Esta casa tiene una importante presencia en el libro Celia en la Revolución (1943, publicado por primera vez en 1987).

Durante la guerra, Chamartín estuvo en la zona republicana, como puede apreciarse en el libro Celia en la Revolución de Elena Fortún.

La calle anexa al complejo (que ahora incluye la Casa Provincial de la congregación) está dedicada a Santa Magdalena Sofía, fundadora del instituto religioso.

El cementerio del pueblo, durante los siglos XIX y XX, se encontraba en los alrededores de la actual estación ferroviaria de Chamartín, bajo algunos edificios que hay en la calle Mauricio Legendre y ocupando parte de la desaparecida elevación que se rebajó para disponer las vías del tren.

Según una ordenanza municipal de 1934, el pueblo se divide en los siguientes barrios: El Pinar, Ventilla, Progreso (que incluye las Cuarenta Fanegas, Ciudad Jardín y Maudes), Atalaya, Huerta del Obispo, Tetuán y Castillejos.