Su cabecera municipal es la localidad homónima de Bokobá.
El toponímico Bokobá significa en idioma maya el lugar donde se boga el agua, ya que proviene de los vocablos bok'ob, batir, bogar y ja', que significa agua.
Pertenece el municipio a la denominada zona henequenera de Yucatán.
Perteneció a la jurisdicción de Ceh Pech antes de la conquista y después estuvo bajo el régimen de las encomiendas: Entre las actividades productivas que se desarrollan en el municipio está preponderantemente la agricultura destacando por su importancia los cultivos de henequén, maíz, frijol, tomate, chile y cítricos.
En cuanto a la ganadería, se ha desarrollado la de bovinos y porcinos.