Al igual que los estados alemanes, el reino de Prusia adoptó como bandera nacional y civil, esta era un bicolor horizontal Negro y Blanco los cuales representaban a la casa real prusiana, la dinastía Hohenzollern.

La bandera Negra-Blanca-Negra con el águila prusiana se adoptó en 1892 cuando tras la Unificación alemana de 1871, el reino prusiano formó parte del Segundo Reich o Imperio alemán hasta 1918 cuando el imperio se transforma en república.

Ya abolida la monarquía de la dinastía Hohenzollern en 1918, en 1919 se crea la República de Weimar ya en la época de la joven república la bandera del Estado Libre de Prusia era el mismo modelo pero versión republicana, porque al águila negra se le retiró las insignias reales y en esta versión se la muestra levantando vuelo.

En 1933 durante la Alemania Nazi se tomó como modelo la bandera anterior, pero el águila militar prusiana llevaba en sus garras una espada y unos rayos, por encima del águila se podía leer el lema Gott mit uns y en su pecho llevaba la esvástica.

Cuando el estado prusiano se declaró extinto en 1947 las banderas se dejaron de usar, aunque hoy en día las banderas reales son utilizadas por los monarquistas alemanes leales y partidarios de la dinastía Hohenzollern.