La antraquinona se encuentra en forma natural en algunas plantas (ruibarbo, espino cerval y el género Aloe), hongos, líquenes e insectos, donde sirve como esqueleto básico para sus pigmentos.
Un derivado de la antraquinona, la antralina es un irritante utilizado en dermatología para combatir la psoriasis.
En este trastorno, el revestimiento del colon adquiere un tono negro marrón oscuro.
Sin embargo, investigaciones más recientes sugieren que este no es el caso.
Una vez más, la investigación no ha demostrado que este sea el caso.