En cambio, en 1718 se casó con el marinero James Bonny, con quien viajó a la isla de Nueva Providencia en las Bahamas.

Se sabe en todo caso que en algún momento entre 1714 y 1718 ella y James Bonny se mudaron a Nueva Providencia (actualmente Nasáu), en las Bahamas, conocida por los piratas ingleses como la autoproclamada República pirata.

Muchos de sus habitantes habían recibido un Perdón del Rey o bien eludieron la ley.

[7]​ Mientras se encontraba en las Bahamas, Anne Bonny comenzó a mezclarse con piratas en las tabernas locales.

Rackham ofreció dinero al esposo de Anne, James Bonny, a cambio del divorcio, pero éste se negó.

Rackham optó por llevarla con él, algo muy inusual, puesto que las mujeres eran consideradas mala suerte a bordo de los barcos.

El gobernador Rogers la mencionó en una circular publicada en The Boston News-Letter, como uno de los "piratas buscados".

Según una narración, Anne quedó embarazada y Rackam la llevó a la isla de Cuba, donde tuvo un hijo.

Según Johnson, las últimas palabras de Bonny al encarcelado Rackham fueron: "Si hubieses luchado como un hombre, no serías ahora ahorcado como un perro".

Permanecieron presas y Mary murió a causa probablemente de las fiebres del parto.

[8]​ Un artículo publicado en 2015, titulado Anne Bonny: Irish American Pirate, asegura que tras su liberación regresó a Carolina del Sur, donde se casó y formó una familia.