Tomando lugar después de la destrucción del Sindicato, esta temporada marca el final de varias otras líneas argumentales; durante esta temporada, Fox Mulder (David Duchovny) pudo conocer el verdadero destino de su hermana, Samantha.
La temporada culmina con Mulder siendo abducido por extraterrestres y Dana Scully (Gillian Anderson) enterándose de que está embarazada.
Como resultado, la temporada sería la última en presentar a Duchovny a tiempo completo hasta la décima temporada del programa (que se emitió en 2016), aunque volvería en las temporadas 8 y 9 como un personaje principal intermitente.
Críticamente, la séptima temporada del programa recibió críticas mixtas a positivas; muchos críticos sintieron que el programa aún producía buenos episodios, pero que era la más débil de las temporadas de Duchovny y Anderson del programa.
Los episodios marcados con una cruz doble (‡) son parte del arco mitológico de la serie.