[2]​ Sin embargo, en 1429 Juan IV regresó a Trebisonda y tomó el control del Imperio.

En esta visita descubrió que Alejandro se había casado con María, hija del señor genovés de Lesbos, Dorino I Gattilusio; según Tafur, Alejandro «estaba preparando barcos para partir hacia Trebisonda contra su hermano».

[5]​[6]​ Otros informes confirman que Alejandro planeaba derrocar a su hermano.

La República de Génova tenía intereses comerciales en Trebisonda que podrían verse perjudicados en una guerra civil entre los hermanos.

Michel Kuršanskis incluso sugiere que Juan IV, que desconfiaba de su hermano menor, había nombrado a Alejandro coemperador, y más tarde designó al joven Alejo V su heredero.