Fue hijo del emperador Alejo IV Gran Comneno y Teodora Cantacucena.

Durante su reinado, el Imperio de Trebisonda fue obligado a pagar un tributo al sultán otomano Mehmed II.

Fue el hijo del emperador Alejo IV Gran Comneno y Teodora Cantacucena.

El ejército imperial, dirigido por el pansebastos Alejando, duque de Mesocaldio, se reunió en Cordile, mientras que Juan IV mismo estaba planeando un ataque por mar, que fue frustrado por las malas condiciones meteorológicas.

El ejército trebero fue derrotado en Cordile y las fuerzas turcomanas llegaron a los muros de la ciudad.

Los otomanos resultaron una amenaza externa más crucial para el Imperio de Trebisonda.

Poco después, en 1448, el cronista bizantino Jorge Frantzés fue enviado a Trebisonda con el fin de completar una alianza matrimonial entre las dos cortes, una alianza que fortalecería sus relaciones y ayudara a enfrentar la común amenaza otomana.

Sin embargo, el peligro resultó aún mayor durante el reinado de Mehmed II y finalmente parecía imposible de interceptar la expansión otomana en Asia Menor.

Casó a su hija Teodora con el gobernante de los Ak Koyunlu Uzun Hasan, quien formó el principal obstáculo para la expansión otomana en Asia Menor y Persia; Juan también le ofreció Capadocia como regalo de bodas.

En 1453, Jorge Amiroutzés fue enviado como embajador a Génova en un intento fallido de salvar las relaciones entre las dos naciones.