Fundador de los colegios Gimnasio Moderno en 1914, Gimnasio Femenino en 1927 en Bogotá y fundador del voluntariado Juventud de la Cruz Roja Colombiana en 1923.
Hermano del periodista Luis Eduardo Nieto Caballero.
Agustín Nieto estudió en Bogotá «entre los 8 y 13 años en el colegio de los Hermanos Cristianos, en el Colegio Americano, en el de los Araujo y Ramírez y en el Liceo Mercantil[nota 1]».
Recibió su formación como licenciado en derecho, filósofo, sociólogo, psicólogo y educador en Francia y Estados Unidos.
A su regreso a Colombia procuró difundir los postulados de la Escuela Nueva en el país.