[4] Fue nombrado miembro en 1484 y, desde 1489 hasta 1495, presidente del consejo de Castilla durante el reinado de los Reyes Católicos, cargo que volvió a desempeñar desde 1501 hasta su muerte en 1503.[3] En 1496 intervino a favor del rey Manuel I de Portugal para negociar su matrimonio con Isabel, la hija primogénita de los Reyes Católicos.[3] Tuvo un rol importante en los descubrimientos geográficos tanto de los castellanos como de los portugueses.Intercedió a favor de Cristóbal Colón entre 1496 y 1498, consiguiendo que se le concediese el diez por ciento de los beneficios.Fue sepultado en Évora, en el convento de San Juan Evangelista,[8] también conocido como el convento dos Lóios, fundado el 6 de mayo de 1485 por su suegro.
Convento de São João Evangelista donde recibió sepultura Álvaro de Braganza
Escudo de armas de Álvaro de Braganza tras su casamiento con Felipa de Melo, con las armas de los Braganza y los Melo
