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Variante beta del SARS-CoV-2

La variante Beta , [1] [2] (B.1.351), [a] fue [5] [6] una variante del SARS-CoV-2 , el virus que causa la COVID-19 . Una de las varias variantes del SARS-CoV-2 que inicialmente se creyó que eran de particular importancia , se detectó por primera vez en el área metropolitana de Nelson Mandela Bay [7] de la provincia del Cabo Oriental de Sudáfrica en octubre de 2020, [8] lo que fue informado por el departamento de salud del país el 18 de diciembre de 2020. [9] El análisis filogeográfico sugiere que esta variante surgió en el área de Nelson Mandela Bay en julio o agosto de 2020. [10]

La Organización Mundial de la Salud etiquetó la variante como variante Beta, no para reemplazar el nombre científico sino como un nombre al que el público pueda referirse comúnmente. [11] [12] La OMS considera que es una variante preocupante que ya no está en circulación. [5]

Nombres

La variante también se conoce como variante sudafricana .

Mutaciones

Hay tres mutaciones de particular interés en la región de la espiga del genoma del linaje B.1.351: [14]

y otras cinco mutaciones de pico que hasta ahora han generado menos preocupación: [14]

Lejos de la región de la espiga, también contiene: K1655N, deleción SGF 3675-3677, P71L y T205I. [15]

Los científicos observaron que la variante puede unirse más fácilmente a las células humanas debido a tres mutaciones en el dominio de unión al receptor (RBD) en la glicoproteína de la espícula del virus: N501Y [9] [16] (un cambio de asparagina (N) a tirosina (Y) [17] en la posición de aminoácido 501), K417N y E484K. [18] [19] Dos de estas mutaciones, E484K y N501Y, están dentro del motivo de unión al receptor (RBM) del dominio de unión al receptor (RBD). [20] [21]

La mutación N501Y también se ha detectado en el Reino Unido. [9] [22] Dos mutaciones encontradas en la variante Beta, E484K y K417N, no se encuentran en la variante Alpha . Además, Beta no tiene la mutación 69-70del que se encuentra en la otra variante. [16] [23]

Eficacia de la vacuna

El 4 de enero de 2021, el periódico británico The Telegraph informó de que el inmunólogo de Oxford Sir John Bell creía que había "un gran interrogante" sobre la posible resistencia de la nueva variante sudafricana a las vacunas contra la COVID-19 , lo que suscitaba temores de que las vacunas no funcionaran con la misma eficacia en esa cepa variante. [24] El mismo día, Shabir Madhi , profesor de vacunología de la Universidad de Witwatersrand , comentó a CBS News que "no es un hecho" que la nueva variante Beta (variante 501.V2) pueda evadir las vacunas, pero que debería considerarse que "podrían no tener la eficacia total". [25] Las mutaciones adicionales de la proteína de pico en Beta fueron planteadas como un factor preocupante por Simon Clarke, profesor asociado de microbiología celular en la Universidad de Reading , ya que "pueden hacer que el virus sea menos susceptible a la respuesta inmunitaria desencadenada por las vacunas". [26] Lawrence Young, virólogo de la Universidad de Warwick , también señaló que las múltiples mutaciones de la variante "podrían provocar cierto escape a la protección inmunitaria". [26]

Se informó que el cambio de aminoácido E484K, una mutación del dominio de unión al receptor (RBD), estaba "asociada con el escape de los anticuerpos neutralizantes", lo que podría afectar negativamente la eficacia de las vacunas COVID dependientes de la proteína Spike. [27] [28] La mutación Spike E484K se relacionó con un caso de reinfección con la variante Beta del SARS-CoV-2 en Brasil, que los investigadores creen que es el primer caso de reinfección de este tipo que involucra esta mutación. [29] La posibilidad de una alteración en la antigenicidad se denominó "mutación de escape" de un anticuerpo monoclonal con la capacidad de neutralizar las variantes de la proteína Spike del SARS-CoV-2. [30] [31] Esto sugiere que las vacunas existentes pueden y deben actualizarse para contrarrestar las nuevas cepas sin recurrir a ensayos por fases.

Janssen

En enero, Johnson & Johnson , que realizó ensayos para su vacuna Janssen (Ad26.COV2.S) en Sudáfrica , informó que el nivel de protección contra la infección moderada a grave por COVID-19 fue del 72% en los Estados Unidos, pero del 64% en Sudáfrica . [32] [33]

Pfizer–BioNTech

El 17 de febrero de 2021, Pfizer anunció que la actividad de neutralización se redujo en dos tercios para la variante Beta, aunque se abstuvo de hacer afirmaciones sobre la eficacia de la vacuna para prevenir enfermedades como resultado de esta variante. [34]

El 16 de marzo de 2021, la Autoridad Reguladora de Productos Sanitarios de Sudáfrica (SAHPRA) aprobó la vacuna Pfizer-BioNTech (BNT162b2) para la Autorización de Uso de Emergencia de la sección 21. [35]

Vacuna Pfizer-BioNTech

El 1 de abril de 2021, una actualización sobre un ensayo de vacunas en Sudáfrica afirmó que la vacuna había sido 100% efectiva hasta el momento (es decir, los participantes vacunados no vieron ningún caso), y que seis de las nueve infecciones en el grupo de control con placebo fueron la variante Beta (linaje B.1.351). [36] Sin embargo, nueve días después, un estudio israelí descubrió que la variante estaba presente incluso en personas que habían recibido ambas dosis de la vacuna, y que su prevalencia era desproporcionada, ocho veces mayor, entre las personas vacunadas en comparación con las cepas salvajes. [37]

El 5 de mayo de 2021, una carta que resumía los resultados del Grupo de Estudio Nacional de Qatar para la Vacunación contra la COVID-19 mostró una eficacia del 75% contra la infección, con cero casos de enfermedad grave. [38]

Oxford-AstraZeneca

El 6 de febrero de 2021, el Financial Times informó que los datos provisionales de un estudio realizado por la Universidad de Witwatersrand de Sudáfrica en colaboración con la Universidad de Oxford demostraron una eficacia reducida de la vacuna Oxford-AstraZeneca contra la COVID-19 (AZD1222) contra la variante Beta. El estudio concluyó que, en una muestra de 2000 personas, la vacuna AZD1222 solo ofrecía una "protección mínima" en todos los casos de COVID-19 , salvo en los más graves . [39]

El 7 de febrero de 2021, el gobierno sudafricano suspendió el despliegue planificado de alrededor de un millón de dosis de la vacuna mientras examinaba los datos y esperaba asesoramiento sobre cómo proceder. [40] Posteriormente, el gobierno sudafricano canceló el uso de la vacuna, vendió su suministro a otros países africanos y modificó su programa de vacunación para utilizar la vacuna Janssen COVID-19 . [41] [42]

En julio de 2021, tras el aumento de la incidencia de la beta en Francia, el Reino Unido (un importante usuario de la vacuna de AstraZeneca) impuso restricciones adicionales a las personas que viajaban al Reino Unido desde Francia. Sin embargo, la incidencia en Francia se da en su territorio del océano Índico de La Reunión [43] , como señaló la política y médica francesa Véronique Trillet-Lenoir [44] .

Sinopharm BIBP

Otros países africanos han comenzado a distribuir la vacuna BIBP de Sinopharm : Marruecos , Egipto , Seychelles y Zimbabue han iniciado la distribución masiva. [45] Hasta ahora, la vacuna ha demostrado ser resistente a la variante Beta, como se demostró en Zimbabue. [46] El 2 de febrero de 2021, un artículo preimpreso anunció que la actividad de neutralización se redujo 1,6 veces para la variante Beta. [47]

Moderna

En febrero, Moderna informó que la vacuna actual ( ARNm-1273 ) produjo solo una sexta parte de los anticuerpos en respuesta a la variante sudafricana en comparación con el virus original. Incluso han lanzado un ensayo de una nueva vacuna para abordar la variante Beta. [48]

Sputnik V

La Autoridad Reguladora de Productos Sanitarios de Sudáfrica (SAHPRA) ha confirmado que ha recibido documentación para la vacuna desarrollada por el Instituto Gamaleya en Rusia . [49]

Sputnik V (Gam-COVID-Vac) es una de las tres vacunas contra la COVID-19 que se han utilizado en todo el mundo con una eficacia superior al 90% en casos sintomáticos. Se ha comprobado que es ligeramente menos eficaz, pero que funciona mejor que sus rivales.[1] Se ha detectado una reducción de tres veces en la VNA frente a la variante beta.[2] [3] Un pequeño estudio de 12 muestras publicado en la revista Nature Communications ha demostrado que la respuesta de anticuerpos neutralizantes es aproximadamente 6,1 veces menor frente a la variante beta. [50]

Vacuna contra la corona

La Autoridad Sudafricana de Productos Sanitarios (SAHPRA) aún no ha aprobado el uso de CoronaVac . [51] Hasta el momento, Sinovac ha ofrecido suministrar a Sudáfrica 5 millones de dosis de la vacuna. [52]

Covaxina

Se ha descubierto que la covaxina es eficaz contra la variante beta, aunque con una reducción de tres veces en la neutralización.

vacuna contra la covid-19

La información sobre la vacuna CoviVac aún no ha sido entregada al gobierno sudafricano. [53]

EpiVacCorona

La información sobre la vacuna EpiVacCorona aún no ha sido entregada al gobierno sudafricano . [54]

ZF2001

La información sobre la vacuna ZF2001 está en proceso de entregarse al gobierno sudafricano . [55]

Novavax

Un estudio sobre la vacuna NVX-CoV2373 de Novavax mostró una eficacia del 60% (para participantes VIH negativos) en Sudáfrica , en comparación con una eficacia del 90% en Gran Bretaña . [56]

InmunidadBio

El Instituto BioVac , una empresa de vacunas sudafricana respaldada por el Estado , planea utilizar un acuerdo que ganó para fabricar vacunas contra el coronavirus . El contrato con ImmunityBio Inc., con sede en Estados Unidos , actualmente está realizando ensayos de fase 1 de la vacuna hAd5 en Estados Unidos y Sudáfrica. [57]

ImmunityBio y BioVac planean distribuir las vacunas en toda Sudáfrica y África. [58] [59]

Epidemiología

Los investigadores y funcionarios informaron que la prevalencia de la variante era mayor entre los jóvenes sin condiciones de salud subyacentes y con mayor frecuencia causa enfermedades graves en esos casos que otras variantes. [60] [61] El departamento de salud sudafricano también indicó que la variante puede estar impulsando la segunda ola de la pandemia de COVID-19 en el país, ya que la variante se propaga más rápido que otras variantes anteriores del virus. [9] [60]

Estadística

Historia

Un equipo de genómica dirigido por la Plataforma de Secuenciación e Innovación en Investigación de KwaZulu-Natal ( KRISP ) de la Universidad de KwaZulu-Natal descubrió la nueva variante. [62] Se descubrió mediante la secuenciación del genoma completo . Varias secuencias genómicas de este linaje se enviaron a la base de datos de secuencias GISAID . [63] [ se necesita una mejor fuente ]

El 23 de diciembre de 2020, el ministro de salud del Reino Unido, Matt Hancock, anunció que dos personas que habían viajado desde Sudáfrica al Reino Unido estaban infectadas con la variante Beta (variante 501.V2). [23] [64] El 28 de diciembre, la variante se había detectado en dos personas en Suiza [65] y en una en Finlandia . [66] El 29 de diciembre, la cepa se había detectado en un visitante de Sudáfrica a Japón , [67] y en un viajero extranjero a Queensland , Australia . [68] El 30 de diciembre, la variante se detectó en Zambia . [69] El 31 de diciembre, también se detectó en Francia , en un pasajero que regresaba de Sudáfrica. [70] El 2 de enero de 2021, se detectó el primer caso de esta variante en Corea del Sur . [71] Austria notificó su primer caso de esta variante, junto con cuatro casos de la variante Alpha el 4 de enero. [72] La República de Botsuana también detectó su primer caso el 4 de enero. [73] La República Popular China notificó el primer caso de esta variante en la provincia meridional de Guangdong el 6 de enero. [74]

El 8 de enero de 2021, la República de Irlanda notificó la detección de 3 casos, todos ellos relacionados con viajes desde Sudáfrica. [75] El mismo día, se notificó un caso de reinfección con la nueva variante en una mujer que había tenido COVID-19 en Brasil , la primera reinfección de este tipo notificada en el mundo. [29] Canadá notificó el primer caso de esta variante en Alberta el 9 de enero, [76] e Israel notificó cuatro casos, todos ellos importados de personas que viajaron desde Sudáfrica. [77] Nueva Zelanda notificó el primer caso de esta variante el 10 de enero. [78] [79] El 12 de enero, Alemania notificó la detección de la mutación en seis personas de tres hogares diferentes. [80] El mismo día, se informó de que el Reino Unido tenía un total de 29 casos, dos de los cuales se habían notificado previamente. [81] Al día siguiente, Bélgica notificó el primer caso en una persona de Flandes Occidental sin antecedentes de viajes, [82] Israel notificó cuatro casos más, [83] y Taiwán notificó el primer caso en un hombre suazi de unos 30 años que había dado positivo en la prueba de COVID-19 el 1 de enero. [84]

El 14 de enero, Alemania detectó otro caso [85] y al día siguiente, Canadá informó de un segundo caso de la mutación que se detectó en la provincia canadiense de Columbia Británica . [86] Se informó de otro caso en Alemania el mismo día. [87] Dinamarca y Reunión informaron de sus primeros casos el 16 de enero, mientras que Israel descubrió otros cuatro casos. [88] [89] [90] El 17 de enero, Israel notificó otros cuatro casos, lo que elevó su número total de casos de esta variante a 20. [91] Se notificaron dos casos más en los Países Bajos el 18 de enero, lo que elevó el total del país a tres. [92] Ghana notificó su primer caso de la variante el 19 de enero. [93] El 23 de enero, Panamá detectó su primer caso de la cepa en una persona de Zimbabwe, que había viajado desde Sudáfrica. [94] También el 23 de enero, Bélgica notificó al menos 15 casos de la variante en Ostende, [95] mientras que se confirmaron 6 casos en las Comoras. [96] El 26 de enero, la República de Irlanda informó de la detección de 6 casos más. [97] Estados Unidos notificó sus primeros casos de la variante el 28 de enero de 2021, en el estado de Carolina del Sur . [98] El 27 de enero, Israel notificó 3 casos más, que fueron los primeros casos de la variante a partir de muestras que se recogieron en la comunidad de forma aleatoria, sin conocer la fuente de infección. [99] Los datos preliminares notificados por los CDC de África el 29 de enero indicaron que la variante había llegado a Ghana . [100] El 31 de enero, Israel notificó su primer caso de reinfección con la nueva variante por un hombre que regresó de Turquía . [101]

El 1 de febrero de 2021, el Secretario de Estado de Salud y Asistencia Social del Reino Unido informó de la detección aleatoria de 11 casos de la variante que no tenían relación con viajes internacionales. [102] El mismo día, la provincia canadiense de Ontario notificó el primer caso de la variante en la región de Peel , con una ausencia similar de antecedentes de viajes y sin contacto con nadie que hubiera estado recientemente en el extranjero. [103] El 8 de febrero, la República de Irlanda notificó la detección de otros 2 casos. [104]

El 8 de febrero de 2021, Austria detectó el mayor brote de la variante Beta en Europa hasta el momento. Se han identificado un total de 293 casos confirmados y 200 casos sospechosos mediante secuenciación, la mayoría de ellos serán confirmados con toda probabilidad. Todos los casos se detectaron en la región del Tirol, donde casi el 9% de las pruebas PCR positivas se identificaron como la variante Beta mediante secuenciación. [105] Los casos activos se estimaron en alrededor de 140. Después de una semana de debate público y presión política sobre una posible cuarentena del Tirol, el gobierno de Austria se abstuvo de aislar las áreas de preocupación, y en su lugar hizo un llamado formal para reducir el movimiento dentro y fuera de la región y realizar pruebas después de visitar el Tirol. [106] Los funcionarios del Tirol declararon su intención de relajar las reglas de bloqueo en el Tirol en consonancia con el resto de Austria. [107]

El 22 de febrero, el Ministerio de Salud israelí declaró que la variante había sido secuenciada genéticamente en poco menos del 1% de 3.000 muestras comunitarias. [108] Posteriormente, Israel notificó un total de 444 casos de la variante, lo que la convierte en la tasa de infección más alta del mundo fuera de Sudáfrica. [109] El 25 de febrero, la República de Irlanda notificó la detección de 4 casos más. [110] A finales de febrero, Turquía tenía 49 casos de la variante Beta. [111]

El 3 de marzo de 2021, Filipinas confirmó sus primeros 6 casos nuevos de la variante sudafricana, con 3 pacientes de Pasay sin antecedentes de viaje y 3 con antecedentes de viaje de Qatar y los Emiratos Árabes Unidos . [112] El 5 de marzo de 2021, Rumania notificó sus primeros dos casos de la variante sudafricana, provenientes de dos pacientes en Bucarest y Pitești . [113]

El 23 de marzo de 2021, Lituania confirmó sus primeros 2 casos nuevos de la cepa sudafricana, 1 en el condado de Kaunas y 1 en Vilnius . Hay 10 casos sospechosos más. Las personas infectadas dijeron que no viajaron a ningún lugar. [114] El 26 de marzo se confirmaron 3 casos más, lo que significa que el virus se está propagando con éxito en el interior.

El 1 de abril de 2021, Malasia detectó sus primeros casos de la variante sudafricana. El Ministerio de Salud informó de dos casos que se cree que se originaron en el grupo de Jalan Lima, que involucraba a un empleado del Aeropuerto Internacional de Kuala Lumpur (KLIA), y otros casos notificados se detectaron escasamente en Selangor . [115] Hasta el 1 de abril, se notificó un total de nueve casos que involucraban a la variante. [116] Hasta el 2 de mayo, se había detectado un total de 48 casos en al menos 5 grupos y a partir del rastreo de contactos, de los cuales 20 se encontraron en dos grupos en Perak y Kelantan . [117]

El 12 de abril de 2021, Turquía tenía 285 casos en 11 provincias. [118]

Extinción

En marzo de 2022, la Organización Mundial de la Salud incluyó las variantes Alfa , Beta y Gamma como circulantes previamente, citando la falta de casos detectados en las semanas y meses anteriores. [119]

Véase también

Notas

  1. ^ Otros nombres incluyen: [3] [4]
    20H/501Y.V2 (anteriormente 20C/501Y.V2)
    variante 501Y.V2
    variante sudafricana del COVID-19

Referencias

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