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Glicosiltransferasa

La mayoría de las enzimas glicosiltransferasas forman uno de dos pliegues: GT-A o GT-B

Las glicosiltransferasas ( GTF , Gtfs ) son enzimas ( EC 2.4 ) que establecen enlaces glucosídicos naturales . Catalizan la transferencia de fracciones de sacáridos desde un azúcar nucleótido activado (también conocido como " donante de glucosilo ") a una molécula aceptora de glucosilo nucleofílica , cuyo nucleófilo puede estar basado en oxígeno ( carbono ), nitrógeno o azufre . [1]

El resultado de la transferencia de glicosilo puede ser un carbohidrato , glicósido , oligosacárido o un polisacárido . Algunas glicosiltransferasas catalizan la transferencia a fosfato inorgánico o agua . La transferencia de glicosilo también puede ocurrir a residuos proteicos , generalmente a tirosina , serina o treonina para dar glicoproteínas O-ligadas , o a asparagina para dar glicoproteínas N-ligadas. Los grupos manosilo pueden transferirse al triptófano para generar C-manosil triptófano, que es relativamente abundante en eucariotas. Las transferasas también pueden usar lípidos como aceptor, formando glicolípidos , e incluso usar donantes de fosfato de azúcar ligados a lípidos, como fosfatos de dolicol en organismos eucariotas o fosfato de undecaprenilo en bacterias.

Las glicosiltransferasas que utilizan donantes de nucleótidos de azúcar son enzimas Leloir , en honor a Luis F. Leloir , el científico que descubrió el primer nucleótido de azúcar y que recibió el Premio Nobel de Química en 1970 por su trabajo sobre el metabolismo de los carbohidratos. Las glicosiltransferasas que utilizan donantes no nucleótidos como el dolicol o el pirofosfato de poliprenol son glicosiltransferasas no Leloir .

Los mamíferos utilizan solo 9 donantes de nucleótidos de azúcar para las glicosiltransferasas: [2] UDP-glucosa , UDP-galactosa , UDP-GlcNAc , UDP-GalNAc, UDP-xilosa, UDP-ácido glucurónico , GDP-manosa , GDP-fucosa y CMP-ácido siálico. Los fosfatos de estas moléculas donantes suelen estar coordinados por cationes divalentes como el manganeso, sin embargo existen enzimas independientes de los metales.

Muchas glicosiltransferasas son proteínas transmembrana de un solo paso y generalmente están ancladas a las membranas del aparato de Golgi [3].

Mecanismo

Las glicosiltransferasas se pueden clasificar en enzimas "retenedoras" o "inversoras" según si la estereoquímica del enlace anomérico del donante se conserva (α→α) o se invierte (α→β) durante la transferencia. El mecanismo de inversión es sencillo y requiere un único ataque nucleofílico del átomo aceptor para invertir la estereoquímica.

El mecanismo de retención ha sido motivo de debate, pero existen pruebas sólidas en contra de un mecanismo de doble desplazamiento (que causaría dos inversiones alrededor del carbono anomérico para una retención neta de la estereoquímica) o un mecanismo disociativo (una variante predominante del cual se conocía como SNi). Se ha propuesto un mecanismo "asociativo ortogonal" que, similar a las enzimas inversoras, requiere solo un único ataque nucleofílico de un aceptor desde un ángulo no lineal (como se observa en muchas estructuras cristalinas) para lograr la retención del anómero. [4]

Reversibilidad de la reacción

El reciente descubrimiento de la reversibilidad de muchas reacciones catalizadas por glicosiltransferasas inversoras supuso un cambio de paradigma en el campo y plantea preguntas respecto de la designación de los nucleótidos de azúcar como donantes "activados". [5] [6] [7] [8] [9]

Clasificación por secuencia

Los métodos de clasificación basados ​​en secuencias han demostrado ser una forma eficaz de generar hipótesis sobre la función de las proteínas en función de la alineación de secuencias con proteínas relacionadas. La base de datos de enzimas activas en carbohidratos presenta una clasificación basada en secuencias de las glicosiltransferasas en más de 90 familias. [10] Se espera que se produzca el mismo plegamiento tridimensional dentro de cada una de las familias. [11]

Estructura

En contraste con la diversidad de estructuras 3D observadas para las glicósido hidrolasas , las glicosiltransferasas tienen un rango mucho más pequeño de estructuras. [12] [13] De hecho, según la base de datos de Clasificación Estructural de Proteínas , solo se han observado tres pliegues diferentes para las glicosiltransferasas [14] Muy recientemente, se identificó un nuevo pliegue de glicosiltransferasa para las glicosiltransferasas involucradas en la biosíntesis de la cadena principal del polímero NAG-NAM del peptidoglicano . [15]

Inhibidores

Se conocen muchos inhibidores de las glicosiltransferasas. Algunos de ellos son productos naturales, como la moenomicina , un inhibidor de las glicosiltransferasas de peptidoglicano, las nikkomicinas , inhibidores de la quitina sintasa, y las equinocandinas , inhibidores de las β-1,3-glucano sintasas fúngicas . Algunos inhibidores de las glicosiltransferasas se utilizan como fármacos o antibióticos. La moenomicina se utiliza en la alimentación animal como promotor del crecimiento. La caspofungina se ha desarrollado a partir de las equinocandinas y se utiliza como agente antifúngico. El etambutol es un inhibidor de las arabinotransferasas micobacterianas y se utiliza para el tratamiento de la tuberculosis. El lufenurón es un inhibidor de las síntesis de quitina de los insectos y se utiliza para controlar las pulgas en los animales. Se han diseñado inhibidores sintéticos de las glicosiltransferasas basados ​​en imidazolio para su uso como agentes antimicrobianos y antisépticos. [16]

Determinante del tipo de sangre

El sistema de grupo sanguíneo ABO está determinado por el tipo de glicosiltransferasas que se expresan en el cuerpo.

El locus del gen ABO que expresa las glicosiltransferasas tiene tres formas alélicas principales: A, B y O. El alelo A codifica la 1-3-N-acetilgalactosaminiltransferasa que une la α - N-acetilgalactosamina al extremo D-galactosa del antígeno H, produciendo el antígeno A. El alelo B codifica la 1-3-galactosiltransferasa que une la α-D-galactosa unida al extremo D-galactosa del antígeno H, creando el antígeno B. En el caso del alelo O, el exón 6 contiene una deleción que da como resultado una pérdida de actividad enzimática. El alelo O difiere ligeramente del alelo A por la deleción de un solo nucleótido: guanina en la posición 261. La deleción causa un cambio de marco y da como resultado la traducción de una proteína casi completamente diferente que carece de actividad enzimática. Esto da como resultado que el antígeno H permanezca sin cambios en el caso de los grupos O.

La combinación de glicosiltransferasas de ambos alelos presentes en cada persona determina si existe un tipo sanguíneo AB, A, B u O.

Usos

Las glicosiltransferasas se han utilizado ampliamente tanto en la síntesis dirigida de glicoconjugados específicos como en la síntesis de bibliotecas diferencialmente glicosiladas de fármacos, sondas biológicas o productos naturales en el contexto del descubrimiento y desarrollo de fármacos (un proceso conocido como glicoaleatorización ). [17] Las enzimas adecuadas se pueden aislar de fuentes naturales o producir de forma recombinante. Como alternativa, se han desarrollado sistemas basados ​​en células completas que utilizan donantes de glicosil endógenos o sistemas basados ​​en células que contienen sistemas clonados y expresados ​​para la síntesis de donantes de glicosil. En los enfoques sin células, la aplicación a gran escala de las glicosiltransferasas para la síntesis de glicoconjugados ha requerido el acceso a grandes cantidades de donantes de glicosil. Por otro lado, se han desarrollado sistemas de reciclaje de nucleótidos que permiten la resíntesis de donantes de glicosil a partir del nucleótido liberado. El enfoque de reciclaje de nucleótidos tiene el beneficio adicional de reducir la cantidad de nucleótidos formados como subproducto, reduciendo así la cantidad de inhibición causada a la glicosiltransferasa de interés, una característica comúnmente observada del subproducto de nucleótidos.

Véase también

Referencias

  1. ^ Williams, GJ; Thorson, JS (2009). "Glicosiltransferasas de productos naturales: propiedades y aplicaciones". Avances en enzimología . Avances en enzimología y áreas relacionadas de la biología molecular. Vol. 76. págs. 55–119. doi :10.1002/9780470392881.ch2. ISBN 9780470392881. Número de identificación personal  18990828.
  2. ^ Etzler ME, Varki A, Cummings RL, Esko JD, Freeze HH, Hart GW, eds. (2008). Fundamentos de glicobiología (2.ª ed.). Plainview, Nueva York: Cold Spring Harbor Laboratory Press. ISBN 978-0-87969-770-9.
  3. ^ Base de datos de transferasas en membranas .
  4. ^ Schuman B, Evans SV, Fyles TM (agosto de 2013). "Los atributos geométricos de las enzimas glicosiltransferasas retenedoras favorecen un mecanismo ortogonal". PLOS ONE . ​​8 (8): e71077. Bibcode :2013PLoSO...871077S. doi : 10.1371/journal.pone.0071077 . PMC 3731257 . PMID  23936487. 
  5. ^ Zhang, C; Griffith, BR; Fu, Q; Albermann, C; Fu, X; Lee, IK; Li, L; Thorson, JS (1 de septiembre de 2006). "Explotación de la reversibilidad de las reacciones catalizadas por glicosiltransferasas de productos naturales". Science . 313 (5791): 1291–4. Bibcode :2006Sci...313.1291Z. doi :10.1126/science.1130028. PMID  16946071. S2CID  38072017.
  6. ^ Zhang, C; Albermann, C; Fu, X; Thorson, JS (27 de diciembre de 2006). "La caracterización in vitro de la avermectina glicosiltransferasa iterativa AveBI revela reversibilidad de la reacción y flexibilidad de los nucleótidos de azúcar". Journal of the American Chemical Society . 128 (51): 16420–1. doi :10.1021/ja065950k. PMID  17177349.
  7. ^ Zhang, C; Fu, Q; Albermann, C; Li, L; Thorson, JS (5 de marzo de 2007). "La caracterización in vitro de la eritronolida micarosiltransferasa EryBV y su utilidad en la diversificación de macrólidos". ChemBioChem . 8 (4): 385–90. doi :10.1002/cbic.200600509. PMID  17262863. S2CID  45058028.
  8. ^ Zhang, C; Moretti, R; Jiang, J; Thorson, JS (13 de octubre de 2008). "La caracterización in vitro de las polienglicosiltransferasas AmphDI y NysDI". ChemBioChem . 9 (15): 2506–14. doi :10.1002/cbic.200800349. PMC 2947747 . PMID  18798210. 
  9. ^ Gantt, RW; Peltier-Pain, P; Cournoyer, WJ; Thorson, JS (21 de agosto de 2011). "Uso de donantes simples para impulsar el equilibrio de las reacciones catalizadas por glicosiltransferasas". Nature Chemical Biology . 7 (10): 685–91. doi :10.1038/nchembio.638. PMC 3177962 . PMID  21857660. 
  10. ^ CAZypedia Glicosiltransferasas
  11. ^ "CAZy Glycosyl Transferase". Archivado desde el original el 23 de marzo de 2009. Consultado el 25 de agosto de 2009 .
  12. ^ Singh, S; Phillips GN, Jr; Thorson, JS (octubre de 2012). "La biología estructural de las enzimas implicadas en la glicosilación de productos naturales". Natural Product Reports . 29 (10): 1201–37. doi :10.1039/c2np20039b. PMC 3627186 . PMID  22688446. 
  13. ^ Chang, A; Singh, S; Phillips GN, Jr; Thorson, JS (diciembre de 2011). "Biología estructural de la glicosiltransferasa y su papel en el diseño de catalizadores para la glicosilación". Current Opinion in Biotechnology . 22 (6): 800–8. doi :10.1016/j.copbio.2011.04.013. PMC 3163058 . PMID  21592771. 
  14. ^ SCOP: Clasificación estructural de proteínas
  15. ^ Lovering AL, de Castro LH, Lim D, Strynadka NC (marzo de 2007). "Información estructural sobre el paso de transglicosilación de la biosíntesis de la pared celular bacteriana". Science . 315 (5817): 1402–5. Bibcode :2007Sci...315.1402L. doi :10.1126/science.1136611. PMID  17347437. S2CID  41658295.
  16. ^ Kocev, A; Melamed, J; Wang, S; Kong, X; Vlahakis, JZ; Xu, Y; Szarek, WA; Brockhausen, I (junio de 2020). "Inhibición del crecimiento bacteriano y la actividad galactosiltransferasa de WbwC por sales de α, ω-bis(3-alquil-1H-imidazolio)alcano: efecto de la variación del contenido de carbono". Química bioorgánica y medicinal . 28 (11): 115494. doi:10.1016/j.bmc.2020.115494. PMID 32312486.
  17. ^ Gantt, RW; Peltier-Pain, P; Thorson, JS (octubre de 2011). "Métodos enzimáticos para la glico(diversificación/aleatorización) de fármacos y moléculas pequeñas". Natural Product Reports . 28 (11): 1811–53. doi :10.1039/c1np00045d. PMID  21901218.