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citoesqueleto procariótico

Elementos del citoesqueleto de Caulobacter crescentus . Los elementos citoesqueléticos procarióticos coinciden con su homólogo eucariota y su función celular hipotética. [1]

El citoesqueleto procariótico es el nombre colectivo de todos los filamentos estructurales de los procariotas . Alguna vez se pensó que las células procarióticas no poseían citoesqueletos , pero los avances en la tecnología de visualización y la determinación de la estructura llevaron al descubrimiento de filamentos en estas células a principios de los años 1990. [2] No sólo se han encontrado en procariotas análogos de todas las principales proteínas citoesqueléticas de los eucariotas , sino que también se han descubierto proteínas citoesqueléticas sin homólogos eucariotas conocidos. [3] [4] [5] [6] Los elementos citoesqueléticos desempeñan funciones esenciales en la división celular , la protección, la determinación de la forma y la determinación de la polaridad en varios procariotas. [7] [8]

superfamilia de tubulina

FtsZ

FtsZ, el primer elemento citoesquelético procariótico identificado, forma una estructura de anillo filamentoso ubicada en el medio de la célula llamada anillo Z que se contrae durante la división celular , similar al anillo contráctil de actina-miosina en eucariotas. [2] El anillo Z es una estructura altamente dinámica que consta de numerosos haces de protofilamentos que se extienden y encogen, aunque el mecanismo detrás de la contracción del anillo Z y el número de protofilamentos involucrados no están claros. [1] FtsZ actúa como una proteína organizadora y es necesaria para la división celular. Es el primer componente del tabique durante la citocinesis y recluta todas las demás proteínas de división celular conocidas en el sitio de división. [9]

A pesar de esta similitud funcional con la actina , FtsZ es homóloga a la tubulina eucariota . Aunque la comparación de las estructuras primarias de FtsZ y tubulina revela una relación débil, sus estructuras tridimensionales son notablemente similares. Además, al igual que la tubulina, el FtsZ monomérico se une al GTP y se polimeriza con otros monómeros de FtsZ con la hidrólisis del GTP en un mecanismo similar a la dimerización de la tubulina . [10] Dado que FtsZ es esencial para la división celular en bacterias, esta proteína es un objetivo para el diseño de nuevos antibióticos . [11] Actualmente existen varios modelos y mecanismos que regulan la formación de anillos Z, pero estos mecanismos dependen de la especie. Varias especies con forma de bastón, incluidas Escherichia coli y Caulobacter crescentus , utilizan uno o más inhibidores del ensamblaje de FtsZ que forman un gradiente bipolar en la célula, lo que mejora la polimerización de FtsZ en el centro celular. [12] Uno de estos sistemas de formación de gradientes consta de proteínas MinCDE (ver más abajo).

superfamilia de actina

MreB

MreB es una proteína bacteriana que se cree que es homóloga a la actina eucariota . MreB y actina tienen una débil coincidencia estructural primaria , pero son muy similares en términos de estructura tridimensional y polimerización de filamentos.

Casi todas las bacterias no esféricas dependen de MreB para determinar su forma. MreB se ensambla en una red helicoidal de estructuras filamentosas justo debajo de la membrana citoplasmática , cubriendo toda la longitud de la célula. [13] MreB determina la forma celular mediando la posición y actividad de las enzimas que sintetizan peptidoglicano y actuando como un filamento rígido debajo de la membrana celular que ejerce presión hacia afuera para esculpir y reforzar la célula. [1] MreB se condensa a partir de su red helicoidal normal y forma un anillo apretado en el tabique de Caulobacter crescentus justo antes de la división celular, un mecanismo que se cree que ayuda a localizar su tabique descentrado. [14] MreB también es importante para la determinación de la polaridad en bacterias polares, ya que es responsable del posicionamiento correcto de al menos cuatro proteínas polares diferentes en C. crescentus . [14]

ParM y Sopa

ParM es un elemento citoesquelético que posee una estructura similar a la actina , aunque se comporta funcionalmente como tubulina . Además, polimeriza bidireccionalmente y exhibe inestabilidad dinámica , ambos comportamientos característicos de la polimerización de tubulina. [4] [15] Forma un sistema con ParR y parC que es responsable de la separación del plásmido R1 . ParM se fija a ParR, una proteína de unión al ADN que se une específicamente a 10 repeticiones directas en la región parC del plásmido R1. Esta unión se produce en ambos extremos del filamento ParM. Luego este filamento se extiende, separando los plásmidos. [16] El sistema es análogo a la segregación de cromosomas eucariotas, ya que ParM actúa como tubulina eucariota en el huso mitótico , ParR actúa como el complejo cinetocoro y parC actúa como el centrómero del cromosoma . [17]

La segregación del plásmido F ocurre en un sistema similar donde SopA actúa como filamento citoesquelético y SopB se une a la secuencia sopC en el plásmido F, como el cinetocoro y el centrómero respectivamente. [17] Últimamente se ha encontrado un homólogo de ParM similar a la actina en una bacteria grampositiva Bacillus thuringiensis , que se ensambla en una estructura similar a microtúbulos y participa en la segregación de plásmidos . [18]

actina arqueal

La crenactina es un homólogo de actina exclusivo del reino arqueal Thermoproteota (anteriormente Crenarchaeota) que se ha encontrado en los órdenes Thermoproteales y Candidatus Korarchaeum . [19] En el momento de su descubrimiento en 2009, tiene la mayor similitud de secuencia con las actinas eucariotas de cualquier homólogo de actina conocido. [20] La crenactina se ha caracterizado bien en Pyryobaculum calidifontis ( A3MWN5 ) y ha demostrado tener una alta especificidad por ATP y GTP. [19] Las especies que contienen crenactina tienen forma de varilla o aguja. En P. calidifontis , se ha demostrado que la crenactina forma estructuras helicoidales que se extienden a lo largo de la célula, lo que sugiere un papel de la crenactina en la determinación de la forma similar al de MreB en otros procariotas. [19] [21]

Aún más cercano al sistema de actina eucariota se encuentra en el superfilo propuesto de Asgardarchaeota . Utilizan versiones primitivas de profilina , gelsolina y cofilina para regular el citoesqueleto. [22]

Grupos únicos

media luna

Crescentin (codificada por el gen creS ) es un análogo de los filamentos intermedios (IF) eucarióticos. A diferencia de otras relaciones análogas discutidas aquí, la crescentina tiene una homología primaria bastante grande con las proteínas IF además de una similitud tridimensional: la secuencia de creS tiene una coincidencia de identidad del 25 % y una similitud del 40 % con la citoqueratina 19 y una coincidencia de identidad del 24 % y 40% de similitud con la lámina nuclear A. Además, los filamentos de media luna tienen aproximadamente 10 nm de diámetro y, por lo tanto, se encuentran dentro del rango de diámetro de los IF eucariotas (8-15 nm). [23] Crescentin forma un filamento continuo de polo a polo a lo largo del lado interno cóncavo de la bacteria Caulobacter crescentus en forma de media luna . Tanto MreB como crescentin son necesarios para que C. crescentus exista en su forma característica; se cree que MreB moldea la célula en forma de varilla y la crescentina dobla esta forma en forma de media luna. [1]

Sistema MinCDE

El sistema MinCDE es un sistema de filamentos que posiciona adecuadamente el tabique en el medio de la célula en Escherichia coli . Según Shih et al., MinC inhibe la formación del tabique al prohibir la polimerización del anillo Z. MinC, MinD y MinE forman una estructura de hélice que enrolla alrededor de la célula y está unida a la membrana por MinD. La hélice MinCDE ocupa un polo y termina en una estructura filamentosa llamada anillo E hecha de MinE en el borde medio de la zona polar. A partir de esta configuración, el anillo E se contraerá y se moverá hacia ese polo, desmontando la hélice MinCDE a medida que avanza. Al mismo tiempo, los fragmentos desmontados se volverán a ensamblar en el extremo polar opuesto, reformando la bobina MinCDE en el polo opuesto mientras la hélice MinCDE actual se descompone. Luego, este proceso se repite, con la hélice MinCDE oscilando de polo a polo. Esta oscilación ocurre repetidamente durante el ciclo celular, manteniendo así MinC (y su efecto inhibidor del tabique) en una concentración promedio de tiempo más baja en el centro de la célula que en los extremos de la célula. [24]

El comportamiento dinámico de las proteínas Min se ha reconstituido in vitro utilizando una bicapa lipídica artificial como imitador de la membrana celular. MinE y MinD se autoorganizaron en ondas proteicas paralelas y en espiral mediante un mecanismo similar a la reacción-difusión. [25]

Bactofilina

La bactofilina ( InterProIPR007607 ) es un elemento citoesquelético de hélice β que forma filamentos en todas las células de la proteobacteria en forma de bastón Myxococcus xanthus . [26] La proteína bactofilina, BacM, es necesaria para el mantenimiento adecuado de la forma celular y la integridad de la pared celular. Las células de M. xanthus que carecen de BacM tienen una morfología deformada caracterizada por un cuerpo celular doblado, y los mutantes bacM tienen una menor resistencia a los antibióticos dirigidos a la pared celular bacteriana. La proteína BacM de M. xanthus se escinde de su forma completa para permitir la polimerización. Las bactofilinas han sido implicadas en la regulación de la forma celular en otras bacterias, incluida la curvatura de las células de Proteus mirabilis , [27] la formación de tallos por Caulobacter crescentus , [28] y la forma helicoidal de Helicobacter pylori . [29]

Ver también

Referencias

  1. ^ abcd Gitai Z (marzo de 2005). "La nueva biología de las células bacterianas: partes móviles y arquitectura subcelular". Celúla . 120 (5): 577–86. doi : 10.1016/j.cell.2005.02.026 . PMID  15766522. S2CID  8894304.
  2. ^ ab Bi EF, Lutkenhaus J (noviembre de 1991). "Estructura del anillo FtsZ asociada con la división en Escherichia coli". Naturaleza . 354 (6349): 161–4. Código Bib :1991Natur.354..161B. doi :10.1038/354161a0. PMID  1944597. S2CID  4329947.
  3. ^ Gunning PW, Ghoshdastider U, Whitaker S, Popp D, Robinson RC (junio de 2015). "La evolución de filamentos de actina composicional y funcionalmente distintos". Revista de ciencia celular . 128 (11): 2009–19. doi : 10.1242/jcs.165563 . PMID  25788699.
  4. ^ ab Popp D, Narita A, Lee LJ, Ghoshdastider U, Xue B, Srinivasan R, Balasubramanian MK, Tanaka T, Robinson RC (junio de 2012). "Nueva estructura de filamentos similar a la actina de Clostridium tetani". La Revista de Química Biológica . 287 (25): 21121–9. doi : 10.1074/jbc.M112.341016 . PMC 3375535 . PMID  22514279. 
  5. ^ Popp D, Narita A, Ghoshdastider U, Maeda K, Maéda Y, Oda T, Fujisawa T, Onishi H, Ito K, Robinson RC (abril de 2010). "Estructuras poliméricas y propiedades dinámicas de la actina bacteriana AlfA". Revista de biología molecular . 397 (4): 1031–41. doi :10.1016/j.jmb.2010.02.010. PMID  20156449.
  6. ^ Wickstead B, Gull K (agosto de 2011). "La evolución del citoesqueleto". La revista de biología celular . 194 (4): 513–25. doi :10.1083/jcb.201102065. PMC 3160578 . PMID  21859859. 
  7. ^ Shih YL, Rothfield L (septiembre de 2006). "El citoesqueleto bacteriano". Reseñas de Microbiología y Biología Molecular . 70 (3): 729–54. doi :10.1128/MMBR.00017-06. PMC 1594594 . PMID  16959967. 
  8. ^ Michie KA, Löwe J (2006). "Filamentos dinámicos del citoesqueleto bacteriano" (PDF) . Revista Anual de Bioquímica . 75 : 467–92. doi : 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142452. PMID  16756499. Archivado desde el original (PDF) el 17 de noviembre de 2006.
  9. ^ Graumann PL (diciembre de 2004). "Elementos citoesqueléticos en bacterias". Opinión actual en microbiología . 7 (6): 565–71. doi :10.1016/j.mib.2004.10.010. PMID  15556027.
  10. ^ Desai A, Mitchison TJ (julio de 1998). "Estructuras de tubulina y FtsZ: implicaciones funcionales y terapéuticas". Bioensayos . 20 (7): 523–7. doi :10.1002/(SICI)1521-1878(199807)20:7<523::AID-BIES1>3.0.CO;2-L. PMID  9722999.
  11. ^ Haydon DJ, Stokes NR, Ure R, Galbraith G, Bennett JM, Brown DR, Baker PJ, Barynin VV, Rice DW, Sedelnikova SE, Heal JR, Sheridan JM, Aiwale ST, Chauhan PK, Srivastava A, Taneja A, Collins I, Errington J, Czaplewski LG (septiembre de 2008). "Un inhibidor de FtsZ con actividad antiestafilocócica potente y selectiva". Ciencia . 321 (5896): 1673–5. Código bibliográfico : 2008 Ciencia... 321.1673H. doi : 10.1126/ciencia.1159961. PMID  18801997. S2CID  7878853.
  12. ^ Haeusser DP, Margolin W (abril de 2016). "Splitsville: conocimientos estructurales y funcionales sobre el anillo Z bacteriano dinámico". Reseñas de la naturaleza. Microbiología . 14 (5): 305–19. doi :10.1038/nrmicro.2016.26. PMC 5290750 . PMID  27040757. 
  13. ^ Kürner J, Medalia O, Linaroudis AA, Baumeister W (noviembre de 2004). "Nuevos conocimientos sobre la organización estructural de citoesqueletos eucariotas y procarióticos mediante tomografía crioelectrónica". Investigación con células experimentales . 301 (1): 38–42. doi :10.1016/j.yexcr.2004.08.005. PMID  15501443.
  14. ^ ab Gitai Z, Dye N, Shapiro L (junio de 2004). "Un gen similar a la actina puede determinar la polaridad celular en las bacterias". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (23): 8643–8. doi : 10.1073/pnas.0402638101 . PMC 423248 . PMID  15159537. 
  15. ^ Garner EC, Campbell CS, Mullins RD (noviembre de 2004). "Inestabilidad dinámica en un homólogo de actina procariótica segregante de ADN". Ciencia . 306 (5698): 1021–5. Código Bib : 2004 Ciencia... 306.1021G. doi : 10.1126/ciencia.1101313. PMID  15528442. S2CID  14032209.
  16. ^ Møller-Jensen J, Jensen RB, Löwe J, Gerdes K (junio de 2002). "Segregación del ADN procariótico mediante un filamento similar a la actina". La Revista EMBO . 21 (12): 3119–27. doi :10.1093/emboj/cdf320. PMC 126073 . PMID  12065424. 
  17. ^ ab Gitai Z (febrero de 2006). "Segregación de plásmidos: emerge una nueva clase de proteínas citoesqueléticas". Biología actual . 16 (4): R133-6. Código Bib : 2006CBio...16.R133G. doi : 10.1016/j.cub.2006.02.007 . PMID  16488865.
  18. ^ Jiang S, Narita A, Popp D, Ghoshdastider U, Lee LJ, Srinivasan R, Balasubramanian MK, Oda T, Koh F, Larsson M, Robinson RC (marzo de 2016). "Los nuevos filamentos de actina de Bacillus thuringiensis forman nanotúbulos para la segregación del ADN plásmido". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 113 (9): E1200-5. Código Bib : 2016PNAS..113E1200J. doi : 10.1073/pnas.1600129113 . PMC 4780641 . PMID  26873105. 
  19. ^ abc Ettema TJ, Lindås AC, Bernander R (mayo de 2011). "Un citoesqueleto basado en actina en arqueas". Microbiología Molecular . 80 (4): 1052–61. doi : 10.1111/j.1365-2958.2011.07635.x . PMID  21414041.
  20. ^ Yutin N, Wolf MY, Wolf YI, Koonin EV (febrero de 2009). "Los orígenes de la fagocitosis y la eucariogénesis". Biología Directa . 4 : 9. doi : 10.1186/1745-6150-4-9 . PMC 2651865 . PMID  19245710. 
  21. ^ Ghoshdastider U, Jiang S, Popp D, Robinson RC (julio de 2015). "En busca del filamento de actina primordial". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 112 (30): 9150–1. doi : 10.1073/pnas.1511568112 . PMC 4522752 . PMID  26178194. 
  22. ^ Akıl, Caner; Tran, Linh T.; Orhant-Prioux, Magali; Baskaran, Yohendran; Manser, Eduardo; Blanchoin, Laurent; Robinson, Robert C. (18 de agosto de 2020). "Conocimientos sobre la evolución de la dinámica de la actina regulada mediante la caracterización de proteínas gelsolina / cofilina primitivas de Asgard archaea". PNAS . 117 (33): 19904–19913. Código Bib : 2020PNAS..11719904A. bioRxiv 10.1101/768580 . doi : 10.1073/pnas.2009167117 . PMC 7444086 . PMID  32747565.  
  23. ^ Ausmees N, Kuhn JR, Jacobs-Wagner C (diciembre de 2003). "El citoesqueleto bacteriano: una función intermedia similar a un filamento en la forma celular". Celúla . 115 (6): 705–13. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00935-8 . PMID  14675535. S2CID  14459851.
  24. ^ Shih YL, Le T, Rothfield L (junio de 2003). "La selección del sitio de división en Escherichia coli implica la redistribución dinámica de proteínas Min dentro de estructuras enrolladas que se extienden entre los dos polos celulares". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (13): 7865–70. Código Bib : 2003PNAS..100.7865S. doi : 10.1073/pnas.1232225100 . PMC 164679 . PMID  12766229. 
  25. ^ Loose M, Fischer-Friedrich E, Ries J, Kruse K, Schwille P (mayo de 2008). "Los reguladores espaciales para la división celular bacteriana se autoorganizan en ondas superficiales in vitro". Ciencia . 320 (5877): 789–92. Código Bib : 2008 Ciencia... 320..789L. doi : 10.1126/ciencia.1154413. PMID  18467587. S2CID  27134918.
  26. ^ Koch MK, McHugh CA, Hoiczyk E (mayo de 2011). "BacM, una bactofilina de Myxococcus xanthus procesada en el extremo N-terminal, es crucial para la forma adecuada de las células". Microbiología Molecular . 80 (4): 1031–51. doi :10.1111/j.1365-2958.2011.07629.x. PMC 3091990 . PMID  21414039. 
  27. ^ Hay NA, Tipper DJ, Gygi D, Hughes C (abril de 1999). "Una nueva proteína de membrana que influye en la forma celular y el enjambre multicelular de Proteus mirabilis". Revista de Bacteriología . 181 (7): 2008–16. doi :10.1128/JB.181.7.2008-2016.1999. PMC 93611 . PMID  10094676. 
  28. ^ Kühn J, Briegel A, Mörschel E, Kahnt J, Leser K, Wick S, Jensen GJ, Thanbichler M (enero de 2010). "Bactofilinas, una clase ubicua de proteínas citoesqueléticas que median la localización polar de una sintasa de la pared celular en Caulobacter crescentus". La Revista EMBO . 29 (2): 327–39. doi :10.1038/emboj.2009.358. PMC 2824468 . PMID  19959992. 
  29. ^ Sycuro LK, Pincus Z, Gutiérrez KD, Biboy J, Stern CA, Vollmer W, Salama NR (mayo de 2010). "La relajación del entrecruzamiento de peptidoglicano promueve la forma helicoidal de Helicobacter pylori y la colonización del estómago". Celúla . 141 (5): 822–33. doi : 10.1016/j.cell.2010.03.046. PMC 2920535 . PMID  20510929.