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Proteínas de unión a potenciadores de CCAAT

Dominio C/EBPα bZip unido al ADN. Entrada PDB 1nwq [1]

Las proteínas de unión al potenciador de CCAAT (o C/EBP ) son una familia de factores de transcripción compuesta por seis miembros, denominados desde C/EBPα hasta C/EBPζ. Promueven la expresión de ciertos genes mediante la interacción con sus promotores . Una vez unidas al ADN , las C/EBP pueden reclutar los llamados coactivadores (como CBP [2] [3] ) que a su vez pueden abrir la estructura de la cromatina o reclutar factores de transcripción basales .

Función

Las proteínas C/EBP interactúan con el motivo de la caja CCAAT ( citosina - citosina- adenosina -adenosina- timidina ), que está presente en varios promotores de genes. Se caracterizan por un dominio de cremallera de leucina básica (bZIP) altamente conservado en el extremo C. Este dominio participa en la dimerización y la unión al ADN, al igual que otros factores de transcripción de la familia que contiene el dominio cremallera de leucina ( c-Fos y c-jun ). La estructura del dominio bZIP de C/EBP está compuesta por una hélice α que forma una estructura de "bobina enrollada" cuando se dimeriza. Los miembros de la familia C/EBP pueden formar homodímeros o heterodímeros con otras C/EBP y con otros factores de transcripción, que pueden contener o no el dominio cremallera de leucina. La dimerización es necesaria para permitir que las C/EBP se unan específicamente al ADN a través de una secuencia palindrómica en el surco principal del ADN. Las proteínas C/EBP también contienen dominios de activación en el extremo N y dominios reguladores.

Estas proteínas se encuentran en los hepatocitos , los adipocitos , las células hematopoyéticas , el bazo , los riñones , el cerebro y muchos otros órganos. Las proteínas C/EBP están involucradas en diferentes respuestas celulares, como en el control de la proliferación, crecimiento y diferenciación celular, en el metabolismo y en la inmunidad . Casi todos los miembros de la familia C/EBP pueden inducir la transcripción a través de sus dominios de activación interactuando con componentes del aparato de transcripción basal. (C/EBPγ es una excepción que carece de un dominio de activación transcripcional funcional). Su expresión está regulada en múltiples niveles, incluso a través de hormonas , mitógenos , citoquinas , nutrientes y otros factores.

Esta proteína se expresa en el sistema nervioso de los mamíferos y desempeña un papel importante en el desarrollo y función de las células nerviosas . C/EBPβ desempeña un papel en la diferenciación neuronal, en el aprendizaje, en los procesos de memoria, en las funciones de las células neuronales y gliales y en la expresión del factor neurotrófico .

Transcripción genética

Los genes C/EBPα , C/EBPβ , C/EBPγ y C/EBPδ no tienen intrones . C/EBPζ tiene cuatro exones ; C/EBPε tiene dos, lo que conduce a cuatro isoformas debido a un uso alternativo de promotores y empalme . Para C/EBPα y C/EBPβ, se pueden producir diferentes tamaños de polipéptidos mediante el uso alternativo de codones de iniciación . Se cree que esto se debe a mecanismos débiles de exploración de ribosomas . El ARNm de C/EBPα puede transcribirse en dos polipéptidos. Para C/EBPβ, se elaboran tres polipéptidos diferentes: LAP* (38 kDa), LAP (35 kDa) y LIP (20 kDa). La isoforma más traducida es LAP, luego LAP* y LIP. LIP puede actuar como inhibidor de las otras C/EBP formando heterodímeros no funcionales.

Regulación

La función de C/EBPβ está regulada por múltiples mecanismos, incluida la fosforilación , acetilación , activación, autorregulación y represión a través de otros factores de transcripción, elementos oncogénicos o quimiocinas . C/EBPβ puede interactuar con CREB , NF-κB y otras proteínas, lo que genera un potencial de transactivación .

La fosforilación de C/EBPβ puede tener un efecto de activación o represión. Por ejemplo, la fosforilación de treonina 235 en C/EBPβ humana, o de treonina 188 en C/EBPβ de ratón y rata, es importante para la capacidad de transactivación de C/EBPβ . La fosforilación (es) de C/EBPβ en su dominio regulador también puede modular su función.

Se demostró en C. elegans que múltiples elementos cis del ARNm 3'UTR de cebp-1 interactúan con mak-2 para regular positivamente la expresión de CEBP-1 en el desarrollo neuronal. [4]

Significación clínica

Papel en la adipogénesis

C/EBPβ y δ se inducen transitoriamente durante las primeras etapas de diferenciación de adipocitos ( adipogénesis ), mientras que C/EBPα se regula positivamente durante las etapas terminales de la adipogénesis. Los estudios in vitro e in vivo han demostrado que cada uno juega un papel importante en este proceso. Por ejemplo, los fibroblastos embrionarios murinos (MEF) de ratones que carecen tanto de C/EBPβ como de C/EBPδ muestran una diferenciación de adipocitos alterada en respuesta a estímulos adipogénicos. [5] Por el contrario, la expresión ectópica de C/EBPβ y δ en preadipocitos 3T3-L1 promueve la adipogénesis, incluso en ausencia de estímulos adipogénicos. [6] [7] C/EBPβ y δ promueven la adipogénesis, al menos en parte induciendo la expresión de los factores de transcripción adipogénicos "maestros" C/EBPα y PPARγ .

C/EBPα es necesario tanto para la adipogénesis como para la función normal de los adipocitos. Por ejemplo, los ratones que carecen de C/EBPα en todos los tejidos excepto el hígado (donde es necesario para evitar la letalidad posnatal) muestran una formación anormal de tejido adiposo . [8] Además, la expresión ectópica de C/EBPα en varias líneas celulares de fibroblastos promueve la adipogénesis. [9] C/EBPα probablemente promueve la adipogénesis al inducir la expresión de PPARγ. [10]

Papel en la osteoporosis

Se ha descubierto que C/EBPβ desempeña un papel en el desarrollo de la osteoporosis . La isoforma completa de la proteína C/EBPβ (LAP) activa el gen MafB , mientras que la isoforma corta (LIP) lo suprime. La activación del gen MafB suprime la formación de osteoclastos . Por tanto, la regulación positiva de LAP disminuye el número de osteoclastos y esto debilita el proceso osteoporótico, mientras que la regulación positiva de LIP hace lo contrario: aumenta la pérdida de masa ósea.

El equilibrio LAP/LIP está determinado por la proteína mTOR . La inhibición de la expresión de mTOR puede detener la actividad de los osteoclastos. [11]

Papel en el cáncer

Las proteínas de unión a CCAAT/potenciadores a menudo participan en la detención del crecimiento y la diferenciación, lo que se ha interpretado en el sentido de que estas proteínas albergan actividades supresoras de tumores. Sin embargo, la sobreexpresión de la proteína de unión a CCAAT/potenciador se correlaciona con un mal pronóstico en el glioblastoma y promueve la inestabilidad genómica en el cáncer de cuello uterino, lo que sugiere un papel oncogénico. Sin embargo, es importante destacar que C/EBPδ actúa como un supresor de tumores en el adenocarcinoma ductal pancreático. Esto es de particular interés ya que sólo se han identificado unos pocos supresores de tumores en el contexto del cáncer de páncreas. [12] La función de las proteínas de unión a CCAAT/potenciadores en el cáncer depende claramente del contexto, pero en gran medida es supresora de tumores.

Papel en la neurodegeneración

Los niveles de C/EBPβ aumentan en muestras corticales de víctimas de la enfermedad de Alzheimer y Parkinson en la autopsia. [13] Los estudios de cultivos celulares en ratones y líneas de microglia humana también encuentran una mayor actividad de C/EBPβ asociada con inflamación patógena y respuestas de citoquinas. "El análisis posterior de genes regulados por C/EBPβ tiene importancia en la respuesta inmune, la salud mitocondrial y la autofagia ". Se ha demostrado que la interferencia molecular de estos procesos celulares desempeña un papel en la patogénesis neurodegenerativa. [14] Las vías genéticas y moleculares con implicaciones degenerativas que involucran a C/EBPβ y sus homólogos se conservan en múltiples organismos modelo, incluidos Mus musculus, Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans y Danio rerio . [14] [15] Los reguladores anteriores de C/EBPβ incluyen genes que se sabe que están asociados con enfermedades neurodegenerativas y del desarrollo neurológico cuando están mutados o desregulados. Esto incluye una vía de respuesta al estrés celular bien caracterizada que involucra a p38 y JNK. [dieciséis]

Referencias

  1. ^ Miller M, Shuman JD, Sebastian T, Dauter Z, Johnson PF (abril de 2003). "Base estructural para el reconocimiento del ADN por la región básica del factor de transcripción de cremallera de leucina CCAAT / proteína alfa de unión potenciadora". La Revista de Química Biológica . 278 (17): 15178–84. doi : 10.1074/jbc.M300417200 . PMID  12578822.
  2. ^ Kovács KA, Steinmann M, Magistretti PJ, Halfon O, Cardinaux JR (septiembre de 2003). "Los miembros de la familia de proteínas de unión a CCAAT/potenciadoras reclutan la proteína de unión a CREB coactivadora y desencadenan su fosforilación". La Revista de Química Biológica . 278 (38): 36959–65. doi : 10.1074/jbc.M303147200 . PMID  12857754.
  3. ^ Ramji DP, Foka P (agosto de 2002). "CCAAT/proteínas de unión a potenciadores: estructura, función y regulación". La revista bioquímica . 365 (parte 3): 561–75. doi :10.1042/BJ20020508. PMC 1222736 . PMID  12006103. 
  4. ^ Sharifnia P, Kim KW, Wu Z, Jin Y (septiembre de 2017). "Distintos elementos cis en la 3 'UTR del ARNm de C. elegans cebp-1 median su regulación en el desarrollo neuronal". Biología del desarrollo . 429 (1): 240–248. doi :10.1016/j.ydbio.2017.06.022. PMC 5828015 . PMID  28673818. 
  5. ^ Tanaka T, Yoshida N, Kishimoto T, Akira S (diciembre de 1997). "Diferenciación defectuosa de adipocitos en ratones que carecen del gen C/EBPbeta y/o C/EBPdelta". La Revista EMBO . 16 (24): 7432–43. doi : 10.1093/emboj/16.24.7432. PMC 1170343 . PMID  9405372. 
  6. ^ Cao Z, Umek RM, McKnight SL (septiembre de 1991). "Expresión regulada de tres isoformas C/EBP durante la conversión adiposa de células 3T3-L1". Genes y desarrollo . 5 (9): 1538–52. doi : 10.1101/gad.5.9.1538 . PMID  1840554.
  7. ^ Yeh WC, Cao Z, Classon M, McKnight SL (enero de 1995). "Regulación en cascada de la diferenciación de adipocitos terminales por tres miembros de la familia C / EBP de proteínas cremallera de leucina". Genes y desarrollo . 9 (2): 168–81. doi : 10.1101/gad.9.2.168 . PMID  7531665.
  8. ^ Linhart HG, Ishimura-Oka K, DeMayo F, Kibe T, Repka D, Poindexter B, Bick RJ, Darlington GJ (octubre de 2001). "C / EBPalpha es necesario para la diferenciación del tejido adiposo blanco, pero no marrón". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 98 (22): 12532–7. Código bibliográfico : 2001PNAS...9812532L. doi : 10.1073/pnas.211416898 . PMC 60088 . PMID  11606718. 
  9. ^ Freytag SO, Paielli DL, Gilbert JD (julio de 1994). "La expresión ectópica de la proteína alfa de unión a potenciador/CCAAT promueve el programa adipogénico en una variedad de células fibroblásticas de ratón". Genes y desarrollo . 8 (14): 1654–63. doi : 10.1101/gad.8.14.1654 . PMID  7958846.
  10. ^ Clarke SL, Robinson CE, Gimble JM (noviembre de 1997). "Las proteínas de unión CAAT / potenciadoras modulan directamente la transcripción del promotor del receptor gamma 2 activado por el proliferador de peroxisomas". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 240 (1): 99-103. doi :10.1006/bbrc.1997.7627. PMID  9367890.
  11. ^ [1], La oxitocina controla la diferenciación de células madre mesenquimales humanas y revierte la osteoporosis
  12. ^ Hartl L, Duitman J, Aberson HL, Chen K, Dijk F, Roelofs JJ, Dings MP, Hooijer GK, Hernanda PY, Pan Q, Busch OR, Besselink MG, Boerman T, Peppelenbosch MP, Bijlsma MF, Spek CA (septiembre) 2020). "CCAAT/Delta de proteína de unión a potenciador (C/EBPδ): un supresor tumoral previamente no reconocido que limita el potencial oncogénico de las células del adenocarcinoma ductal pancreático". Cánceres (Basilea) . 12 (9): 2546. doi : 10.3390/cánceres12092546 . PMC 7564797 . PMID  32906832. 
  13. ^ Strohmeyer, Ron; Shelton, Jadd; Lougheed, Christopher; Breitkopf, Trisia (22 de enero de 2014). Gao, Hongwei (ed.). "Expresión y elevación de la proteína β de unión potenciadora de CCAAT en la enfermedad de Alzheimer y cultivos de células microgliales". MÁS UNO . 9 (1): e86617. Código Bib : 2014PLoSO...986617S. doi : 10.1371/journal.pone.0086617 . ISSN  1932-6203. PMC 3899300 . PMID  24466171. 
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