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Bienvenido Instituto Sanger

El Wellcome Sanger Institute , anteriormente conocido como The Sanger Center y Wellcome Trust Sanger Institute , es un instituto británico de investigación en genómica y genética sin fines de lucro , financiado principalmente por Wellcome Trust . [1]

Está ubicado en el Wellcome Genome Campus junto al pueblo de Hinxton , en las afueras de Cambridge . Comparte esta ubicación con el Instituto Europeo de Bioinformática . Fue establecido en 1992 y lleva el nombre del doble premio Nobel Frederick Sanger . [2] [3] Fue concebido como un centro de secuenciación de ADN a gran escala para participar en el Proyecto Genoma Humano , y llegó a hacer la mayor contribución individual a la secuencia estándar de oro del genoma humano . Desde sus inicios, el instituto estableció y ha mantenido una política de intercambio de datos y realiza gran parte de su investigación en colaboración .

Desde 2000, el instituto amplió su misión para comprender "el papel de la genética en la salud y la enfermedad". [4] El instituto emplea actualmente a unas 900 personas [5] y se dedica a cinco áreas principales de investigación: cáncer, envejecimiento y mutaciones somáticas; Genética Celular; Genética Humana; Parásitos y Microbios; y el Árbol de la Vida.

Instalaciones y recursos

Instalaciones

El campus del genoma de Wellcome
Vidriera conmemorativa ubicada en el edificio Sulston del Wellcome Sanger Institute, con motivo de la apertura del Genome Campus

En 1993, los entonces 17 empleados del Centro Sanger se trasladaron a un laboratorio temporal en Hinxton Hall en Cambridgeshire . [6] Este sitio de 55 acres (220.000 m 2 ) se convertiría en el Wellcome Genome Campus, que tiene una población creciente de alrededor de 1.300 empleados, aproximadamente 900 de los cuales trabajan en el Instituto Sanger. [7] El Genome Campus también incluye el centro de conferencias Wellcome Trust [8] y el Instituto Europeo de Bioinformática . En 2005 se inauguró oficialmente una importante ampliación del campus; [9] los edificios albergan nuevos laboratorios, un centro de datos y comodidades para el personal. [10] Al discutir el nombre del centro, Sanger (todavía vivo cuando se abrió el centro) le dijo a John Sulston , el director fundador, que el centro "será mejor que sea bueno". Sulston comentó: "Preferiría no haber preguntado". [11]

Secuenciación

El personal de secuenciación del Instituto Sanger maneja millones de muestras de ADN cada semana. [ cita necesaria ] El instituto "aprovecha tecnologías de vanguardia para responder preguntas que no tenían respuesta hace sólo unos años". [12] Los avances tecnológicos permiten al Instituto Sanger llevar a cabo la secuenciación de los genomas de humanos individuales, especies de vertebrados y patógenos , a un ritmo cada vez mayor y reduciendo costos. El instituto tiene más de 100 proyectos de secuenciación de patógenos en curso. [13] La producción del Instituto Sanger es de alrededor de 10 mil millones de bases de datos de secuencia sin procesar por día. [14]

Recursos científicos

Los recursos de bases de datos bioinformáticas son uno de los resultados de los programas de investigación en los que participa el Instituto Sanger. Los alojados por el Instituto Sanger incluyen:

Se iniciaron varias bases de datos en el Instituto Sanger, pero ahora están alojadas en otros lugares:

Investigación

El edificio Morgan (derecha), parte del Instituto Sanger

La investigación científica en el Instituto Sanger está organizada en cinco programas científicos, cada uno de los cuales define un área importante de investigación con un enfoque biológico, de enfermedad o analítico particular. Los Programas actuales del Instituto Sanger son Cáncer, Envejecimiento y Mutación Somática, Genética Celular, Genética Humana, Parásitos y Microbios y Árbol de la Vida. Los estudios de todos los programas proporcionan información sobre la evolución humana, patógena y celular, las consecuencias fenotípicas y, por tanto, biológicas, de la variación del genoma y los procesos que causan mutaciones.

Programa de Cáncer, Envejecimiento y Mutaciones Somáticas

Proporciona liderazgo en agregación de datos e innovación informática, desarrolla modelos celulares de cáncer de alto rendimiento para exámenes funcionales de todo el genoma y pruebas de fármacos, y explora el papel de la mutación somática en la evolución, el envejecimiento y el desarrollo clonal. Este Programa incluye el Proyecto Genoma del Cáncer .

Programa de Genética Celular

Explora la función de los genes humanos mediante el estudio del impacto de la variación del genoma en la biología celular. Se utilizan exámenes sistemáticos a gran escala para descubrir el impacto de las mutaciones del genoma que ocurren de forma natural y diseñadas en células pluripotentes inducidas por humanos (hIPSC), sus derivados diferenciados y otros tipos de células. Es uno de los programas fundadores que impulsa la creación y organización de la iniciativa internacional Human Cell Atlas .

Programa de Genética Humana

La investigación del instituto en genética humana se centra en la caracterización de la variación genética humana en la salud y la enfermedad. Además de la contribución del instituto al Proyecto Genoma Humano , los investigadores del Instituto Sanger han realizado contribuciones en diversas áreas de investigación relacionadas con enfermedades, comparación de poblaciones y genética evolutiva . En enero de 2008, el lanzamiento del Proyecto 1000 Genomas , una colaboración con científicos de todo el mundo, marcó un esfuerzo para secuenciar los genomas de 1000 individuos con el fin de crear el "mapa más detallado de la variación genética humana para respaldar los estudios de enfermedades". [25] Los datos de los proyectos piloto estuvieron disponibles gratuitamente en bases de datos públicas en junio de 2010. [26] En 2010, el Instituto Sanger anunció su participación en el proyecto UK10K, [27] [28] [29] que secuenciará los genomas de 10.000 individuos para identificar variantes genéticas raras y sus efectos en la salud humana. El Instituto Sanger también forma parte del Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer , un esfuerzo internacional para describir diferentes tipos de tumores cancerosos . [30] También forma parte de los programas de investigación GENCODE y ENCODE [31] para crear una enciclopedia de elementos del ADN. [ cita necesaria ]

El Programa aplica la genómica a estudios a escala poblacional para identificar las variantes causales y las vías involucradas en las enfermedades humanas y sus efectos en la biología celular. También modela trastornos del desarrollo para explorar qué aspectos físicos podrían ser reversibles.

Programa de Patógenos y Microbios

Investiga los mecanismos subyacentes comunes de la evolución, la infección y la resistencia a la terapia para reforzar la comprensión de las bacterias , los virus y los parásitos , con especial interés en la malaria . También explora los efectos de la variación del genoma en la biología de las interacciones huésped - patógeno , en particular la respuesta del huésped a la infección y el papel de la microiotia en la salud y la enfermedad. Todos los genomas después de la secuenciación están disponibles en la base de datos mantenida in situ en la web, GeneDB. [ cita necesaria ]

Programa Árbol de la Vida

El Programa Árbol de la Vida se creó en 2019 para investigar la diversidad de organismos complejos que se encuentran en el Reino Unido a través de secuenciación y tecnologías celulares. También compara y contrasta las secuencias del genoma de las especies para desbloquear conocimientos sobre la evolución y la conservación. Este programa desempeñará un papel destacado en el Proyecto Darwin Árbol de la Vida, una iniciativa a escala del Reino Unido para secuenciar los genomas de las 66.000 especies complejas ( eucariotas ) de las Islas Británicas.

Colaboraciones

Gran parte de la investigación del Instituto Sanger se lleva a cabo en colaboración con la comunidad científica en general ; Más del 90 por ciento de los trabajos de investigación del instituto implican colaboraciones con otras organizaciones. [32] Las colaboraciones importantes incluyen:

Compromiso público

Niños en un evento de divulgación pública enhebran pulseras de cuatro colores para deletrear una secuencia de ADN.

El Instituto Sanger tiene un programa de actividades de participación pública . El programa tiene como objetivo hacer que la investigación biomédica compleja sea accesible a una variedad de audiencias, incluidos estudiantes y sus maestros, y miembros de la comunidad local.

El programa de Comunicación y Participación Pública tiene como objetivo "fomentar el debate informado sobre cuestiones relevantes para la investigación del Instituto Sanger" [36] y "fomentar una comunidad de investigadores que puedan interactuar eficazmente con diferentes audiencias". [36] El instituto recibe visitas de más de 1.500 estudiantes, profesores y grupos comunitarios por año. Los visitantes podrán conocer al personal científico, recorrer el instituto y sus instalaciones y participar en debates y actividades éticas. El programa también ofrece sesiones de desarrollo profesional para profesores de GCSE y ciencias post 16 a través de la red nacional de Centros de Aprendizaje de Ciencias , y organiza visitas para grupos interesados ​​en actualizar sus conocimientos en genética contemporánea. También se ofrecen videoconferencias en el Instituto Sanger para centros de aprendizaje de ciencias, centros de ciencias y escuelas.

El personal científico y de participación pública también colabora y contribuye a proyectos nacionales como la exposición itinerante InsideDNA [37] del Reino Unido y Who am I? galería en el Museo de Ciencias . [38] También participan en eventos públicos como el Festival de Ciencias de Cambridge.

formación de posgrado

El instituto opera dos programas de formación de doctorado: un curso de cuatro años para graduados en ciencias básicas y un curso de tres años para médicos. El curso de cuatro años requiere que los estudiantes roten entre tres laboratorios diferentes para ampliar sus horizontes científicos antes de elegir un proyecto de doctorado. Cada estudiante debe elegir al menos un proyecto experimental y uno de rotación de base informática. [39] El instituto alberga aproximadamente 50 estudiantes predoctorales, todos los cuales están registrados en la Universidad de Cambridge . [40]

Oficiales

Según Companies House, los cinco directivos de la empresa matriz Genome Research Limited son Henry Parkinson, Kay Elizabeth Davies, Rolf Dieter Heuer, James Cuthbert Smith y David Lindsay Willetts. [41] Según el sitio web de Sanger, Henry Parkinson es el jefe de asuntos jurídicos. [42]

Personal

En 2023, Sanger emplea a más de mil personas y está dirigido por Matthew_Hurles . El personal científico, profesores y ex alumnos destacados se enumeran a continuación:

Facultad académica

En 2019, un cuerpo docente de 32 científicos lidera investigaciones basadas en hipótesis , en busca de respuestas a preguntas biomédicas. [43] Entre otros, estos incluyen a Dominic Kwiatkowski , Nicole Soranzo , Michael Stratton , Sarah Teichmann y Matthew Hurles . El instituto también cuenta con varios miembros del cuerpo docente asociado, becarios internacionales y profesores honorarios. Estos incluyen a Adrian Bird , Ewan Birney , Chris Ponting , Fiona Powrie , Stephen O'Rahilly , Antonio Vidal-Puig y Wolf Reik , entre otros.

consejo asesor científico

El Consejo de Administración de Sanger está guiado por el consejo asesor científico [44] cuyos miembros incluyen al profesor David Altshuler , al profesor Anton Berns , al profesor David J. Lipman , al profesor Kevin Marsh y al profesor Sir Paul Nurse .

Antiguos alumnos

Los miembros anteriores de la facultad de Sanger incluyen: [45]

Historia

El Instituto Wellcome Trust Sanger se estableció en 1992, financiado por Wellcome Trust y el Consejo de Investigación Médica del Reino Unido .

Gestión

John E. Sulston fue el director fundador del Instituto Sanger. Sulston jugó un papel decisivo en la elección del sitio de Hinxton para el instituto y permaneció allí como director hasta el anuncio de la finalización del borrador del genoma humano en 2000. [48] Sulston se graduó en la Universidad de Cambridge en 1963 y completó su doctorado sobre el síntesis química del ADN en 1966. [49] Compartió el Premio Nobel de Fisiología o Medicina de 2002 con Robert Horvitz y Sydney Brenner , [50] dos años después de dimitir como director del instituto.

En el año 2000, Allan Bradley dejó su nombramiento como profesor en el Baylor College of Medicine , en Estados Unidos, para asumir el cargo de director del Instituto Sanger. Bradley quería aprovechar los logros alcanzados por el Instituto Sanger en el Proyecto Genoma Humano "concentrándose en la función genética, la genómica del cáncer y los genomas de organismos modelo como el ratón y el pez cebra". [51] Bradley recibió su licenciatura, maestría y doctorado en genética de la Universidad de Cambridge. [52] [53] [54] [55]

En 2010, Bradley dejó su puesto de liderazgo para formar una nueva empresa , pero permanece en el cuerpo docente del instituto como director emérito. Mike Stratton , líder del Proyecto Genoma del Cáncer y del Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer , fue nombrado director del Instituto Sanger en mayo de ese año. [56]

Proyecto Genoma Humano

El Instituto Sanger se inauguró en 1993, tres años después del inicio del Proyecto Genoma Humano , y llegó a hacer la mayor contribución individual a la secuencia estándar de oro del genoma humano , publicada en 2004. [57] El instituto se dedicó a colaboraciones para secuenciar 8 de los 23 pares de cromosomas humanos ( 1 , 6 , 9 , 10 , 13 , 20 , 22 y X ). [58] Desde la publicación del genoma humano, la investigación llevada a cabo en el instituto se ha desarrollado más allá de la secuenciación de organismos hacia diversas áreas de investigación biomédica, incluidos estudios sobre enfermedades como el cáncer, la malaria y la diabetes.

Controversia

En agosto de 2018 se informó que se estaba llevando a cabo una investigación sobre las acusaciones de acoso al personal y discriminación de género formuladas contra la alta dirección del Wellcome Trust Sanger Institute , incluido el director. [59] La investigación, llevada a cabo por el abogado Thomas Kibling de Matrix Chambers , concluyó en octubre de 2018 y absolvió a Stratton de cualquier irregularidad, al tiempo que enumeró áreas de mejora en el funcionamiento del Instituto Sanger. [60] [61] Se cuestionaron las conclusiones y la independencia de la investigación. [62]

En octubre de 2019 se informó que el instituto había fabricado una herramienta médica con la intención de monetizarla a pesar de no tener aprobación ética ni legal para hacerlo y haber sido informado por la Universidad de Stellenbosch y denunciantes internos. [63]

Referencias

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