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Glicosiltransferasa

La mayoría de las enzimas glicosiltransferasas forman uno de dos pliegues: GT-A o GT-B.

Las glicosiltransferasas ( GTF , Gtfs ) son enzimas ( EC 2.4 ) que establecen enlaces glicosídicos naturales . Catalizan la transferencia de restos sacáridos desde un azúcar nucleótido activado (también conocido como " donante de glicosilo ") a una molécula aceptora de glicosilo nucleófila , cuyo nucleófilo puede estar basado en oxígeno ( carbono ), nitrógeno o azufre . [1]

El resultado de la transferencia de glicosilo puede ser un carbohidrato , un glucósido , un oligosacárido o un polisacárido . Algunas glicosiltransferasas catalizan la transferencia a fosfato inorgánico o agua . La transferencia de glicosilo también puede ocurrir a residuos de proteínas , generalmente a tirosina , serina o treonina para dar glicoproteínas unidas a O , o a asparagina para dar glicoproteínas unidas a N. Los grupos manosilo pueden transferirse al triptófano para generar C-manosil triptófano, que es relativamente abundante en eucariotas. Las transferasas también pueden utilizar lípidos como aceptores, formando glicolípidos , e incluso utilizar donadores de fosfato de azúcar unidos a lípidos, como los fosfatos de dolicol en organismos eucariotas o el fosfato de undecaprenilo en bacterias.

Las glicosiltransferasas que utilizan donantes de nucleótidos de azúcar son enzimas Leloir , en honor a Luis F. Leloir , el científico que descubrió el primer nucleótido de azúcar y que recibió el Premio Nobel de Química en 1970 por su trabajo sobre el metabolismo de los carbohidratos. Las glicosiltransferasas que utilizan donantes no nucleotídicos como el dolicol o el pirofosfato de poliprenol son glicosiltransferasas no Leloir .

Los mamíferos utilizan solo 9 donantes de nucleótidos de azúcar para las glicosiltransferasas: [2] UDP-glucosa , UDP-galactosa , UDP-GlcNAc , UDP-GalNAc, UDP-xilosa, UDP-ácido glucurónico , GDP-manosa , GDP-fucosa y CMP-siálico. ácido. Los fosfatos de estas moléculas donantes suelen estar coordinados por cationes divalentes como el manganeso; sin embargo, existen enzimas independientes de metales.

Muchas glicosiltransferasas son proteínas transmembrana de paso único y generalmente están ancladas a las membranas del aparato de Golgi [3].

Mecanismo

Las glicosiltransferasas se pueden segregar en enzimas "retenedoras" o "invertidas" según si la estereoquímica del enlace anomérico del donante se retiene (α→α) o se invierte (α→β) durante la transferencia. El mecanismo de inversión es sencillo y requiere un único ataque nucleofílico del átomo aceptor para invertir la estereoquímica.

El mecanismo de retención ha sido un tema de debate, pero existe evidencia sólida en contra de un mecanismo de doble desplazamiento (que causaría dos inversiones alrededor del carbono anomérico para una retención neta de la estereoquímica) o un mecanismo disociativo (una variante frecuente del cual se conocía como SNi). Se ha propuesto un mecanismo "asociativo ortogonal" que, similar a las enzimas inversoras, requiere sólo un único ataque nucleofílico de un aceptor desde un ángulo no lineal (como se observa en muchas estructuras cristalinas) para lograr la retención del anómero. [4]

Reversibilidad de la reacción

El reciente descubrimiento de la reversibilidad de muchas reacciones catalizadas por la inversión de glicosiltransferasas sirvió como un cambio de paradigma en este campo y plantea interrogantes sobre la designación de nucleótidos de azúcar como donantes "activados". [5] [6] [7] [8] [9]

Clasificación por secuencia

Los métodos de clasificación basados ​​en secuencias han demostrado ser una forma poderosa de generar hipótesis sobre la función de las proteínas basadas en la alineación de secuencias con proteínas relacionadas. La base de datos de enzimas activas sobre carbohidratos presenta una clasificación basada en secuencias de glicosiltransferasas en más de 90 familias. [10] Se espera que ocurra el mismo pliegue tridimensional dentro de cada una de las familias. [11]

Estructura

En contraste con la diversidad de estructuras 3D observadas para las glucósido hidrolasas , las glicosiltransferasas tienen una gama mucho menor de estructuras. [12] [13] De hecho, según la base de datos de Clasificación Estructural de Proteínas , solo se han observado tres pliegues diferentes para las glicosiltransferasas [14] Muy recientemente, se identificó un nuevo pliegue de glicosiltransferasas para las glicosiltransferasas involucradas en la biosíntesis de NAG- "Esqueleto polimérico NAM de peptidoglicano" . [15]

Inhibidores

Se conocen muchos inhibidores de las glicosiltransferasas. Algunos de estos son productos naturales, como la moenomicina , un inhibidor de las peptidoglicano glicosiltransferasas, las nikkomicinas , inhibidores de la quitina sintasa, y las equinocandinas , inhibidores de las β-1,3-glucano sintasas de hongos . Algunos inhibidores de la glicosiltransferasa se utilizan como fármacos o antibióticos. La moenomicina se utiliza en la alimentación animal como promotor del crecimiento. La caspofungina se desarrolló a partir de las equinocandinas y se utiliza como agente antifúngico. El etambutol es un inhibidor de las arabinotransferasas micobacterianas y se utiliza para el tratamiento de la tuberculosis. El lufenurón es un inhibidor de la síntesis de quitina de insectos y se utiliza para controlar las pulgas en animales. Los inhibidores sintéticos de las glicosiltransferasas a base de imidazolio se han diseñado para su uso como agentes antimicrobianos y antisépticos. [dieciséis]

Determinante del tipo de sangre

El sistema del grupo sanguíneo ABO está determinado por el tipo de glicosiltransferasas que se expresan en el cuerpo.

El locus del gen ABO que expresa las glicosiltransferasas tiene tres formas alélicas principales: A, B y O. El alelo A codifica la 1-3-N-acetilgalactosaminiltransferasa que une la α- N-acetilgalactosamina al extremo D-galactosa del antígeno H, produciendo el gen A. antígeno. El alelo B codifica la 1-3-galactosiltransferasa que une la α-D-galactosa unida al extremo D-galactosa del antígeno H, creando el antígeno B. En el caso del alelo O, el exón 6 contiene una deleción que resulta en una pérdida de actividad enzimática. El alelo O difiere ligeramente del alelo A por la eliminación de un único nucleótido: la guanina en la posición 261. La eliminación provoca un cambio de marco y da como resultado la traducción de una proteína casi completamente diferente que carece de actividad enzimática. Esto da como resultado que el antígeno H permanezca sin cambios en el caso de los grupos O.

La combinación de glicosiltransferasas por ambos alelos presentes en cada persona determina si existe un tipo de sangre AB, A, B u O.

Usos

Las glicosiltransferasas se han utilizado ampliamente tanto en la síntesis dirigida de glicoconjugados específicos como en la síntesis de bibliotecas de fármacos, sondas biológicas o productos naturales glicosilados diferencialmente en el contexto del descubrimiento y desarrollo de fármacos (un proceso conocido como glicorandomización ). [17] Las enzimas adecuadas pueden aislarse de fuentes naturales o producirse de forma recombinante. Como alternativa, se han desarrollado sistemas basados ​​en células completas que utilizan donantes de glicosilo endógenos o sistemas basados ​​en células que contienen sistemas clonados y expresados ​​para la síntesis de donantes de glicosilo. En enfoques sin células, la aplicación a gran escala de glicosiltransferasas para la síntesis de glicoconjugados ha requerido acceso a grandes cantidades de donantes de glicosilo. Por otro lado, se han desarrollado sistemas de reciclaje de nucleótidos que permiten la resíntesis de donantes de glicosilo a partir del nucleótido liberado. El enfoque de reciclaje de nucleótidos tiene el beneficio adicional de reducir la cantidad de nucleótidos formados como subproducto, reduciendo así la cantidad de inhibición causada a la glicosiltransferasa de interés, una característica comúnmente observada del subproducto de nucleótidos.

Ver también

Referencias

  1. ^ Williams, GJ; Thorson, JS (2009). Producto natural glicosiltransferasas: propiedades y aplicaciones . Avances en enzimología y áreas relacionadas de la biología molecular. vol. 76, págs. 55-119. doi :10.1002/9780470392881.ch2. ISBN 9780470392881. PMID  18990828.
  2. ^ Etzler ME, Varki A, Cummings RL, Esko JD, Freeze HH, Hart GW, eds. (2008). Fundamentos de glicobiología (2ª ed.). Plainview, Nueva York: Prensa del laboratorio Cold Spring Harbor. ISBN 978-0-87969-770-9.
  3. ^ Transferasas en la base de datos de membranas .
  4. ^ Schuman B, Evans SV, Fyles TM (agosto de 2013). "Los atributos geométricos de las enzimas glicosiltransferasas de retención favorecen un mecanismo ortogonal". MÁS UNO . 8 (8): e71077. Código Bib : 2013PLoSO...871077S. doi : 10.1371/journal.pone.0071077 . PMC 3731257 . PMID  23936487. 
  5. ^ Zhang, C; Griffith, BR; Fu, Q; Albermann, C; Fu, X; Lee, IK; Pequeño; Thorson, JS (1 de septiembre de 2006). "Explotación de la reversibilidad de reacciones catalizadas por glicosiltransferasas de productos naturales". Ciencia . 313 (5791): 1291–4. Código bibliográfico : 2006 Ciencia... 313.1291Z. doi : 10.1126/ciencia.1130028. PMID  16946071. S2CID  38072017.
  6. ^ Zhang, C; Albermann, C; Fu, X; Thorson, JS (27 de diciembre de 2006). "La caracterización in vitro de la avermectina glicosiltransferasa iterativa AveBI revela la reversibilidad de la reacción y la flexibilidad de los nucleótidos del azúcar". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 128 (51): 16420–1. doi :10.1021/ja065950k. PMID  17177349.
  7. ^ Zhang, C; Fu, Q; Albermann, C; Pequeño; Thorson, JS (5 de marzo de 2007). "La caracterización in vitro de la eritronolida micarosiltransferasa EryBV y su utilidad en la diversificación de macrólidos". ChemBioChem . 8 (4): 385–90. doi :10.1002/cbic.200600509. PMID  17262863. S2CID  45058028.
  8. ^ Zhang, C; Moretti, R; Jiang, J; Thorson, JS (13 de octubre de 2008). "La caracterización in vitro de las polienglicosiltransferasas AmphDI y NysDI". ChemBioChem . 9 (15): 2506–14. doi :10.1002/cbic.200800349. PMC 2947747 . PMID  18798210. 
  9. ^ Gantt, RW; Peltier-Pain, P; Cournoyer, WJ; Thorson, JS (21 de agosto de 2011). "Uso de donantes simples para impulsar los equilibrios de reacciones catalizadas por glicosiltransferasa". Biología Química de la Naturaleza . 7 (10): 685–91. doi :10.1038/nchembio.638. PMC 3177962 . PMID  21857660. 
  10. ^ CAZypedia Glicosiltransferasas
  11. ^ CAZy glicosiltransferasa
  12. ^ Singh, S; Phillips GN, Jr.; Thorson, JS (octubre de 2012). "La biología estructural de las enzimas implicadas en la glicosilación de productos naturales". Informes de productos naturales . 29 (10): 1201–37. doi :10.1039/c2np20039b. PMC 3627186 . PMID  22688446. 
  13. ^ Chang, A; Singh, S; Phillips GN, Jr.; Thorson, JS (diciembre de 2011). "Biología estructural de la glicosiltransferasa y su papel en el diseño de catalizadores para la glicosilación". Opinión Actual en Biotecnología . 22 (6): 800–8. doi :10.1016/j.copbio.2011.04.013. PMC 3163058 . PMID  21592771. 
  14. ^ SCOP: Clasificación estructural de proteínas
  15. ^ Lovering AL, de Castro LH, Lim D, Strynadka NC (marzo de 2007). "Visión estructural del paso de transglicosilación de la biosíntesis de la pared celular bacteriana". Ciencia . 315 (5817): 1402–5. Código Bib : 2007 Ciencia... 315.1402L. doi : 10.1126/ciencia.1136611. PMID  17347437. S2CID  41658295.
  16. ^ Kočev, A; Melamed, J; Wang, S; Kong, X; Vlahakis, JZ; Xu, Y; Szarek, WA; Brockhausen, I (junio de 2020). "Inhibición del crecimiento bacteriano y la actividad galactosiltransferasa de WbwC por sales de alcano de α, ω-bis (3-alquil-1H-imidazolio): efecto de la variación del contenido de carbono". Química Bioorgánica y Medicinal . 28 (11): 115494. doi:10.1016/j.bmc.2020.115494. PMID 32312486.
  17. ^ Gantt, RW; Peltier-Pain, P; Thorson, JS (octubre de 2011). "Métodos enzimáticos para glico(diversificación/aleatorización) de fármacos y moléculas pequeñas". Informes de productos naturales . 28 (11): 1811–53. doi :10.1039/c1np00045d. PMID  21901218.