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Terri Attwood

Teresa K. Attwood (nacida el 20 de noviembre de 1959) es profesora de Bioinformática en el Departamento de Ciencias de la Computación y la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad de Manchester e investigadora visitante en el Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI) . [5] Obtuvo una beca de investigación universitaria de la Royal Society en el University College de Londres (UCL) de 1993 a 1999 y en la Universidad de Manchester de 1999 a 2002. [1]

Educación

Attwood obtuvo su Licenciatura en Ciencias en Biofísica en la Universidad de Leeds en 1982. [6] Obtuvo un doctorado , también en Biofísica, dos años más tarde, en 1984 [2] bajo la supervisión de John E. Lydon [7] estudiando mesofases cromónicas .

Investigación y carrera

Attwood realizó investigaciones postdoctorales en Leeds hasta 1993, cuando se trasladó al University College de Londres [8] durante cinco años antes de trasladarse a la Universidad de Manchester en 1999. Su investigación [9] [10] se centra en la alineación de secuencias de proteínas y el análisis de proteínas .

Inspirada por la creación de PROSITE , Attwood desarrolló un método de huellas dactilares de proteínas y lo utilizó para establecer la base de datos PRINTS [11] [12] [13] . Con Amos Bairoch buscó unificar el trabajo sobre la clasificación y anotación de familias de proteínas , y finalmente consiguió una subvención de la Unión Europea junto con Rolf Apweiler para establecer InterPro , [14] [15] con Pfam , ProDom y Swiss-Prot/TrEMBL como socios del consorcio en 1997. [16]

Attwood ha dirigido proyectos importantes, incluido el consorcio de minería de texto BioMinT FP5 [17] , el consorcio de educación en bioinformática EMBER [18] (que incluye a EBI y al Instituto Suizo de Bioinformática como socios) y la Plataforma EPSRC PARADIGM. [19] Es la investigadora principal de Manchester en los proyectos SeqAhead ( red de análisis de datos de secuenciación de próxima generación ) [20] y AllBio (infraestructura bioinformática para ciencias unicelulares, animales y vegetales), [21] y también fue investigadora principal de Manchester en EMBRACE [22] y EuroKUP (proteómica de riñones y orina). [23] Attwood fue miembro del Comité de Estrategia de Capacitación en Bioinformática de ELIXIR (Paquete de trabajo 11) [24] durante la fase preparatoria de ELIXIR. Actualmente es presidenta de la Red Global de Bioinformática EMBnet , fue miembro de los Comités Ejecutivos de la Sociedad Internacional de Biocuración y de la Red de Capacitación en Bioinformática, y recientemente fue elegida miembro de la Junta Directiva de la Sociedad Internacional de Biología Computacional. En 2012, encabezó la creación de una GOBLET (Organización Global para el Aprendizaje, la Educación y la Capacitación en Bioinformática), con las principales sociedades, redes y organizaciones de bioinformática, biología computacional y biocuración como socios. A partir de 2016 , Attwood es la presidenta de la Junta Ejecutiva de GOBLET. [25] [26]

Además de ser biocuradora [16] [27], ha co-desarrollado herramientas para alinear y visualizar secuencias y estructuras de proteínas, incluyendo Ambrosia y CINEMA. [28] [29] El grupo está construyendo componentes de software reutilizables para crear aplicaciones bioinformáticas útiles a través de UTOPIA (herramientas bioinformáticas) , [30] [31] y están desarrollando nuevos enfoques para la anotación automática y minería de texto , como PRECIS, [32] METIS, [33] BioIE, [34] y enfoques semánticos para la integración de datos, [35] como el Semantic Biochemical Journal [36] publicado por Portland Press . Las herramientas UTOPIA sustentan tanto el Semantic Biochemical Journal como un proyecto colaborativo con Pfizer y AstraZeneca para desarrollar una interfaz del siglo XXI para la literatura biomédica y la gestión de datos.

La investigación de Attwood ha recibido financiación del Consejo de Investigación en Ingeniería y Ciencias Físicas , [37] el Consejo de Investigación en Biotecnología y Ciencias Biológicas , el Wellcome Trust , la Royal Society , la Unión Europea y la industria. [6]

Enseñanza

Attwood enseña en cursos de pregrado y posgrado y ha sido asesor de doctorado o co-supervisor de varios estudiantes de doctorado (por ejemplo, Manuel Corpas ). Attwood ha sido coautor de varios capítulos de libros y tres libros de texto de bioinformática populares: Introducción a la bioinformática [38] y Bioinformática y evolución molecular . [39] Attwood es coautor del libro de texto de bioinformática Desafíos de la bioinformática en la interfaz de la biología y la ciencia de la computación: Mind the Gap [40] con Steve Pettifer y Dave Thorne.

Servicio académico

Attwood es miembro del consejo editorial de Biochemical Journal , [41] Database: The Journal of Biological Databases and Curation , [42] Molecular and Cellular Proteomics , [ cita requerida ] Journal of Molecular Graphics and Modelling y EMBnet.journal. [ cita requerida ]

Premios y honores

Attwood obtuvo una beca de investigación universitaria de la Royal Society (URF) entre 1993 y 2002. [1]

Referencias

  1. ^ abc Anónimo (2016). "Teresa Attwood, profesora de bioinformática". manchester.ac.uk . Manchester. Archivado desde el original el 24 de diciembre de 2016.
  2. ^ ab Attwood, Teresa K. (1984). Mesofases cromónicas (tesis doctoral). Universidad de Leeds. OCLC  59334329.
  3. ^ Corpas, Manuel (2007). Patrones de plegamiento en secuencias de proteínas (tesis doctoral). Universidad de Manchester. doi :10.6084/m9.figshare.964811.v1.
  4. ^ Teresa Attwood en la Biblioteca del Congreso
  5. ^ 57193816586 Publicaciones de Attwood, Teresa indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (se requiere suscripción)
  6. ^ desde el ORCID de Terri Attwood  0000-0003-2409-4235
  7. ^ Attwood, TK; Lydon, JE (1984). "Formación de mesofase liotrópica por fármacos antiasmáticos". Cristales moleculares y cristales líquidos . 108 (3–4): 349. Código Bibliográfico :1984MCLC..108..349A. doi :10.1080/00268948408078686.
  8. ^ "Teresa K Attwood". biochem.ucl.ac.uk/bsm/dbbrowser .
  9. ^ Terri K. Attwood en el servidor de bibliografía DBLP
  10. ^ Publicaciones de Terri Attwood indexadas por Google Scholar
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  41. ^ "Biochemical Journal Editorial Board". Archivado desde el original el 20 de febrero de 1999. Consultado el 25 de julio de 2012 .
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