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Terri Atwood

Teresa K. Attwood (nacida el 20 de noviembre de 1959) es profesora de Bioinformática en el Departamento de Informática y Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad de Manchester y miembro visitante del Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI) . [5] Obtuvo una beca de investigación de la Royal Society University en el University College London (UCL) de 1993 a 1999 y en la Universidad de Manchester de 1999 a 2002. [1]

Educación

Attwood obtuvo su Licenciatura en Biofísica en la Universidad de Leeds en 1982. [6] Obtuvo un doctorado , también en Biofísica, dos años después, en 1984 [2] bajo la supervisión de John E. Lydon [7] estudiando mesofases cromónicas .

Investigación y carrera

Attwood realizó una investigación postdoctoral en Leeds hasta 1993, cuando se mudó al University College London [8] durante cinco años antes de mudarse a la Universidad de Manchester en 1999. Su investigación [9] [10] se refiere a la alineación de secuencias de proteínas y al análisis de proteínas .

Inspirándose en la creación de PROSITE , Attwood desarrolló un método de toma de huellas dactilares de proteínas y lo utilizó para establecer la base de datos PRINTS [11] [12] [13] . Con Amos Bairoch, buscó unificar el trabajo sobre clasificación y anotación de familias de proteínas , y finalmente obtuvo una subvención de la Unión Europea con Rolf Apweiler para establecer InterPro , [14] [15] con Pfam , ProDom y Swiss-Prot/TrEMBL como socios del consorcio en 1997. . [dieciséis]

Attwood ha liderado proyectos importantes, incluido el consorcio de minería de textos BioMinT FP5 [17] , el consorcio de educación en bioinformática EMBER [18] (que incluye a EBI y el Instituto Suizo de Bioinformática como socios) y la plataforma EPSRC PARADIGM. [19] Es la investigadora principal de Manchester en los proyectos SeqAhead ( red de análisis de datos de secuenciación de próxima generación ) [20] y AllBio (infraestructura bioinformática para ciencias unicelulares, animales y vegetales), [21] y también fue IP de Manchester en EMBRACE [22 ] y EuroKUP (proteómica renal y urinaria). [23] Attwood fue miembro del Comité de Estrategia de Capacitación en Bioinformática de ELIXIR (Paquete de Trabajo 11) [24] durante la fase preparatoria de ELIXIR. Actualmente es presidenta de la Red Global de Bioinformática EMBnet , fue miembro de los Comités Ejecutivos de la Sociedad Internacional de Biocuración y de la Red de Capacitación en Bioinformática, y recientemente fue elegida miembro de la Junta Directiva de la Sociedad Internacional de Biología Computacional. En 2012, encabezó el establecimiento de GOBLET (Organización Global para el Aprendizaje, la Educación y la Capacitación en Bioinformática), con las principales sociedades, redes y organizaciones de bioinformática, biología computacional y biocuración como socios. A partir de 2016 , Attwood es el presidente de la junta ejecutiva de GOBLET. [25] [26]

Además de ser biocuradora [16] [27] , ha codesarrollado herramientas para alinear y visualizar secuencias y estructuras de proteínas, incluidas Ambrosia y CINEMA. [28] [29] El grupo está construyendo componentes de software reutilizables para crear aplicaciones bioinformáticas útiles a través de UTOPIA (herramientas de bioinformática) , [30] [31] y está desarrollando nuevos enfoques para la anotación automática y la minería de texto , como PRECIS, [32 ] METIS, [33] BioIE, [34] y enfoques semánticos para la integración de datos, [35] como el Semantic Biochemical Journal [36] publicado por Portland Press . Las herramientas UTOPIA sustentan tanto el Semantic Biochemical Journal como un proyecto de colaboración con Pfizer y AstraZeneca para desarrollar una interfaz del siglo XXI para la literatura biomédica y la gestión de datos.

La investigación de Attwood ha recibido financiación del Consejo de Investigación en Ingeniería y Ciencias Físicas , [37] el Consejo de Investigación en Biotecnología y Ciencias Biológicas , el Wellcome Trust , la Royal Society , la Unión Europea y la industria. [6]

Enseñando

Attwood enseña en cursos de pregrado y posgrado y ha sido asesor de doctorado o cosupervisor de varios estudiantes de doctorado (por ejemplo, Manuel Corpas ). Attwood es coautor de varios capítulos de libros y tres libros de texto de bioinformática populares: Introducción a la bioinformática [38] y Bioinformática y evolución molecular . [39] Attwood es coautor del libro de texto de bioinformática Bioinformatics Challenges at the Interface of Biology and Computer Science: Mind the Gap [40] con Steve Pettifer y Dave Thorne.

Servicio academico

Attwood forma parte del consejo editorial de Biochemical Journal , [41] Base de datos: The Journal of Biological Databases and Curation , [42] Molecular and Cellular Proteomics , [ cita necesaria ] Journal of Molecular Graphics and Modeling y EMBnet.journal. [ cita necesaria ]

Premios y honores

Attwood obtuvo una beca de investigación de la Royal Society University (URF) de 1993 a 2002. [1]

Referencias

  1. ^ abc Anón (2016). "Teresa Attwood Profesora de Bioinformática". manchester.ac.uk . Manchester. Archivado desde el original el 24 de diciembre de 2016.
  2. ^ ab Attwood, Teresa K. (1984). Mesofases cromónicas (tesis doctoral). Universidad de Leeds. OCLC  59334329.
  3. ^ Corpas, Manuel (2007). Patrones de plegado en secuencias de proteínas (tesis doctoral). Universidad de Manchester. doi : 10.6084/m9.figshare.964811.v1.
  4. ^ Teresa Attwood en la Biblioteca del Congreso
  5. ^ 57193816586 Attwood, publicaciones de Teresa indexadas por la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
  6. ^ ab ORCID de Terri Attwood  0000-0003-2409-4235
  7. ^ Attwood, conocimientos tradicionales; Lydon, JE (1984). "Formación de mesofase liotrópica por fármacos antiasmáticos". Cristales Moleculares y Cristales Líquidos . 108 (3–4): 349. Código bibliográfico : 1984MCLC..108..349A. doi : 10.1080/00268948408078686.
  8. ^ "Teresa K. Attwood". biochem.ucl.ac.uk/bsm/dbbrowser .
  9. ^ Terri K. Attwood en el servidor de bibliografía DBLP
  10. ^ Publicaciones de Terri Attwood indexadas por Google Scholar
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