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Amós Bairoch

Amos Bairoch (nacido el 22 de noviembre de 1957) [1] es un bioinformático suizo [3] [6] [7] y profesor de Bioinformática en el Departamento de Ciencias de Proteínas Humanas de la Universidad de Ginebra , donde dirige el grupo CALIPHO [8] en el Instituto Suizo de Bioinformática (SIB), que combina bioinformática, curación y esfuerzos experimentales para caracterizar funcionalmente las proteínas humanas. [9]

Su padre fue el historiador económico Paul Bairoch .

Educación

Su primer proyecto como estudiante de doctorado fue el desarrollo de PC/Gene, [10] un paquete de software basado en MS-DOS para el análisis de secuencias de proteínas y nucleótidos. PC/Gene fue comercializado primero por una empresa suiza (Genofit) y luego por Intelligenetics en los EE. UU., que luego fue comprada por Oxford Molecular. [ cita requerida ]

Investigación

Su principal trabajo [2] se centra en el campo del análisis de secuencias de proteínas y, más concretamente, en el desarrollo de bases de datos y herramientas de software para este fin. Su contribución más importante es la incorporación del conocimiento humano mediante una cuidadosa anotación manual de datos relacionados con las proteínas. [11]

Mientras trabajaba en PC/Gene, comenzó a desarrollar una base de datos de secuencias de proteínas anotadas que se convirtió en Swiss-Prot y se publicó por primera vez en julio de 1986. [12] Desde 1988 en adelante ha sido un proyecto colaborativo con el grupo de la Biblioteca de Datos del Laboratorio Europeo de Biología Molecular que luego evolucionó hasta convertirse en el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI).

La base de datos Swiss-Prot es el principal recurso de secuencias de proteínas del mundo y ha sido un instrumento de investigación clave tanto para bioinformáticos como para científicos de laboratorio en una amplia gama de aplicaciones. [13] Una medida de su éxito es el reciente desarrollo de UniProt, el catálogo de información sobre proteínas más completo del mundo. [14] UniProt es un recurso de información central de secuencias y funciones de proteínas creado mediante la unión de la información contenida en las bases de datos Swiss-Prot , TrEMBL y American Protein Information Resource (PIR) .

En 1988, comenzó a desarrollar PROSITE [15], una base de datos de familias y dominios de proteínas. Poco después creó ENZYME [16] [17] [18] [19] [20], una base de datos de nomenclatura sobre enzimas, así como SeqAnalRef [21] , una base de datos de referencia bibliográfica de análisis de secuencias. [22] [23]

En colaboración con Ron Appel, inició, en agosto de 1993, el primer servidor WWW de biología molecular, ExPASy . [24] Lo que fue concebido como un prototipo creció rápidamente hasta convertirse en un sitio importante que proporciona acceso a las numerosas bases de datos producidas parcial o totalmente en Ginebra, así como a muchas herramientas para el análisis de proteínas (proteómica).

En 1998, junto con colegas de Ginebra y Lausana, fue uno de los fundadores del SIB Swiss Institute of Bioinformatics, cuya misión es establecer en Suiza un centro de excelencia en el campo de la bioinformática con énfasis en la investigación, la educación, los servicios y el desarrollo de bases de datos y herramientas. [25]

En noviembre de 1997, junto con Ron Appel y Denis Hochstrasser, fundó GeneBio (Geneva Bioinformatics SA), una empresa dedicada al conocimiento biológico. En abril de 2000, las personas mencionadas anteriormente, junto con Keith Rose y Robin Offord, fundaron GeneProt (Geneva Proteomics), una empresa de proteómica de alto rendimiento que cesó sus operaciones en 2005. [26]

Desde 2009, en el marco del grupo CALIPHO, dirigido por él mismo y Lydie Lane, está involucrado en el desarrollo de neXtProt [27] [28] [29], un recurso que tiene como objetivo proporcionar a los científicos de la vida un amplio espectro de conocimientos sobre todas las proteínas humanas.

También participa en el desarrollo del Cellosaurus, una fuente de conocimiento sobre líneas celulares.

Según Google Scholar [2] y Scopus , [6] hasta 2015, sus artículos revisados ​​por pares más citados en revistas científicas se han publicado en Nucleic Acids Research , [30] [31] [32] [33] [34] Biochemical Journal , [35] [36] Nature , [37] Briefings in Bioinformatics , [38] y Database . [39]

Premios y honores

Bairoch recibió el Premio Friedrich Miescher de 1993 de la Sociedad Suiza de Bioquímica, el Premio de Incentivo de la Fundación Helmut Horten de 1995, el premio Pehr Edman de 2004, el Premio Europeo Latsis de 2004 , el premio Otto Naegeli de 2010, el Premio al Logro Distinguido HUPO de 2011 en Ciencias Proteómicas, [40] el premio pionero en proteómica de la EUPA de 2013, [1] y en 2018 el Premio ABRF .

Citas

A medida que el proceso avanza, llegamos al punto en que cada genoma que pueda secuenciarse será secuenciado. [41]

Referencias

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  6. ^ Publicaciones de Amos Bairoch indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
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  8. ^ "Página del grupo CALIPHO (Computer Analysis and Laboratory Investigation of Proteins of Human Origin) en el sitio web de la SIB". Archivado desde el original el 20 de abril de 2013.
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