Cromosoma humano
El cromosoma 5 es uno de los 23 pares de cromosomas de los seres humanos . Normalmente, las personas tienen dos copias de este cromosoma. El cromosoma 5 abarca unos 182 millones de pares de bases (los componentes básicos del ADN ) y representa casi el 6% del ADN total de las células . El cromosoma 5 es el quinto cromosoma humano más grande, pero tiene una de las densidades genéticas más bajas . Esto se explica en parte por numerosas regiones pobres en genes que muestran un grado notable de conservación no codificante y sinténica con vertebrados no mamíferos , lo que sugiere que están limitados funcionalmente. [4]
Dado que el cromosoma 5 es responsable de muchas formas de crecimiento y desarrollo ( divisiones celulares ), los cambios pueden causar cánceres . Un ejemplo sería la leucemia mieloide aguda (LMA). [5]
Genes
Número de genes
A continuación se presentan algunas de las estimaciones del recuento de genes del cromosoma 5 humano. Debido a que los investigadores utilizan diferentes enfoques para la anotación del genoma, sus predicciones del número de genes en cada cromosoma varían (para obtener detalles técnicos, consulte predicción de genes ). Entre los diversos proyectos, el proyecto de secuencia de codificación de consenso colaborativo ( CCDS ) adopta una estrategia extremadamente conservadora. Por lo tanto, la predicción del número de genes del CCDS representa un límite inferior en el número total de genes codificadores de proteínas humanas. [6]
Lista de genes
La siguiente es una lista parcial de genes en el cromosoma humano 5. Para ver la lista completa, consulte el enlace en el cuadro de información a la derecha.
- ABLIM3 : proteína codificante de la proteína LIM 3 que se une a la actina
- ADAMTS2 : metalopeptidasa ADAM con motivo de trombospondina tipo 1, 2
- AGXT2 : Alanina-glioxilato aminotransferasa 2
- ANKRD31 : proteína codificante del dominio de repetición de anquirina 31
- APBB3 : proteína codificante del miembro 3 de la familia de proteínas precursoras de la beta amiloide A4
- APC : adenomatosis poliposis del colon
- ARL15 : proteína codificante del factor de ribosilación de ADP similar al 15
- BRIX1 : Homólogo de la proteína de biogénesis de ribosomas BRX1 (también BXDC2)
- C1QTNF3 : proteína 3 relacionada con el factor de necrosis tumoral C1q del complemento
- C5orf45 : Marco de lectura abierto del cromosoma 5 45
- C5orf47 : proteína codificante del marco de lectura abierto del cromosoma 5 47
- C5orf49 : proteína codificante Marco de lectura abierto del cromosoma 5 49
- REPARTO : Calpastatina
- CDO1 : proteína codificante de la cisteína dioxigenasa tipo 1
- CPLANE1 : Ciliogénesis y efector de polaridad planar 1
- CPLX2 : Compleja-2
- CREBRF : proteína codificante del factor regulador CREB3
- CXXC5 : proteína de dedo zing de tipo CXXC 5
- DPYSL3 : proteína similar a la dihidropirimidinasa 3
- EGR1 : proteína de respuesta al crecimiento temprano 1
- ERAP1 : aminopeptidasa 1 del retículo endoplásmico (anteriormente llamada ARTS-1 )
- ERAP2 : aminopeptidasa 2 del retículo endoplásmico
- ESM1 : Molécula 1 específica de células endoteliales
- DTDST : transportador de sulfato de displasia diastrófica
- EIF4E1B : proteína codificante del factor de iniciación de la traducción eucariota 4E, miembro de la familia 1B
- ERCC8 : reparación por escisión que complementa la deficiencia de reparación en roedores, grupo de complementación 8
- FAF2 : proteína codificante del miembro 2 de la familia del factor asociado a Fas
- FAM172A : proteína codificante UPF0528 proteína FAM172A
- FAM105B : proteína codificante de la familia con similitud de secuencia 105, miembro B
- FAM114A2 : proteína codificante FAM114A2
- FAM71B : proteína codificante de la familia con similitud de secuencia de 71 miembros B
- FASTKD3 : proteína 3 que contiene el dominio de la quinasa FAST
- FBXL7 : proteína F-box/repetición LRR 7
- FCHSD1 : proteína FCH y de doble dominio SH3 1
- FGF1 : factor de crecimiento de fibroblastos 1 (factor de crecimiento de fibroblastos ácido)
- FGFR4 : receptor 4 del factor de crecimiento de fibroblastos
- GM2A : Activador del gangliósido GM2
- GNPDA1 : glucosamina-6-fosfato isomerasa 1
- GPBP1 : Vasculina
- HEXB : hexosaminidasa B (polipéptido beta)
- HMGXB3 : proteína codificante que contiene la caja HMG 3
- IK : Proteína roja
- IRX1 : proteína homeodominio de clase Iroquois (humana)
- LARP1 : proteína 1 relacionada con La
- LMAN2 : unión de manosa a lectina 2
- Proteína codificante LNCR3 Susceptibilidad al cáncer de pulmón 3
- LPCAT1 : Lisofosfatidilcolina aciltransferasa 1
- LYRM7 : proteína codificante del motivo LYR que contiene 7
- LYSMD3 : LysM y proteína 3 que contiene el supuesto dominio de unión al peptidoglicano
- MAN2A1 : Alfa-manosidasa 2
- MASS1: homólogo monogénico, audiogénico, de susceptibilidad a convulsiones 1 (ratón)
- MCC : proteína mutante del cáncer colorrectal
- MCCC2 : metilcrotonoil-coenzima A carboxilasa 2 (beta)
- MCEF : factor de transcripción de la familia AF4/FMR2, miembro 4
- MEF2C : Factor potenciador específico de miocitos 2C
- MEF2C-AS1 : proteína codificante del ARN antisentido 1 MEF2C
- MGAT1 : Manosil (alfa-1,3-)-glicoproteína beta-1,2-N-acetilglucosaminiltransferasa
- MINAR2 : proteína codificante similar a Kiaa1024
- MIR1271 : codifica el microARN 1271
- MIR146A : microARN 146a
- MTRR : 5-metiltetrahidrofolato-homocisteína metiltransferasa reductasa
- MZB1 : proteína específica de las células de la zona marginal B y B1
- NIPBL : Homólogo de Nipped-B (Drosophila)
- NREP : Proteína relacionada con la regeneración neuronal
- Proteína codificante NSA2 Proteína nuclear 1 inducible por TGF beta
- NSD1 : proteína correguladora de la transcripción
- NSUN2 : Familia de dominios NOP2/Sun, miembro 2
- NR2F1 : Receptor de hormonas nucleares
- NSG2 : proteína codificante de la proteína Hmp19
- NUDCD2 : proteína 2 que contiene el dominio NudC
- P4HA2 : subunidad alfa-2 de la prolil 4-hidroxilasa
- PCBD2 : pterina-4-alfa-carbinolamina deshidratasa 2
- PELO : Homólogo de pelota
- PGGT1B : proteína codificante de la subunidad beta de la proteína geranilgeraniltransferasa tipo I
- PHAX : Adaptador fosforilado para la exportación de ARN
- Pikachurin : Responsable del funcionamiento de las sinapsis de la cinta ; permite al ojo rastrear objetos en movimiento.
- PFDN1 : subunidad 1 de prefoldina
- POLR3G : proteína codificante de la polimerasa (ARN) III (dirigida por ADN) polipéptido G (32 kD)
- PPIP5K2 : difosfoinositol pentakisfosfato quinasa 2
- PRCC1 : espiral 1 rica en prolina
- PRR16 : proteína codificante Proteína rica en prolina 16
- PURA : Proteína A de unión a elementos rica en purinas
- PWWP2A : proteína codificante del dominio PWWP que contiene 2A
- RANBP3L : proteína codificante de la proteína de unión a RAN 3-like
- RASGEF1C : proteína codificante del miembro 1C de la familia del dominio RasGEF
- RMND5B : Necesario para la división nuclear meiótica 5 homólogo B
- SFXN1 : sideroflexina-1
- SKIV2L2 : ARN helicasa 2 similar a Ski2
- SLC22A5 : transportador de solutos de la familia 22 (transportador de cationes orgánicos), miembro 5
- SLC26A2 : transportador de solutos de la familia 26 (transportador de sulfato), miembro 2
- SH3TC2 : repeticiones de dominio y tetratricopeptídico 2
- SLCO4C1 : Transportador de solutos, miembro de la familia de transportadores de aniones orgánicos 4c1
- SLU7 : factor de empalme de pre-ARNm SLU7
- SMN1 : neurona motora de supervivencia 1, telomérica
- SMN2 : neurona motora de supervivencia 2, centromérica
- SNCAIP : sinucleína, proteína que interactúa con alfa (sinfilina)
- SPEF2 : proteína flagelar del esperma 2
- SPINK5 : inhibidor de la serina proteasa tipo Kazal 5 (LEKTI)
- SPINK6 : inhibidor de la serina proteasa tipo Kazal 6
- SPINK9 : inhibidor de la serina proteasa tipo Kazal 9 (LEKTI-2)
- SPZ1 : proteína de cremallera de leucina espermatogénica 1
- STC2 : Estaniocalcina-2
- TBCA : chaperona A específica de la tubulina
- TCOF1 : Síndrome de Treacher Collins-Franceschetti 1
- TGFBI : queratoepitelina
- THG1L : probable ARNt(His) guanililtransferasa
- TICAM2 : Molécula adaptadora que contiene el dominio TIR 2
- TMEM171 : proteína codificante Proteína transmembrana 171
- TNFAIP8 : Factor de necrosis tumoral, proteína 8 inducida por alfa
- TSSK1B : proteína codificante de la serina quinasa 1b específica del testículo
- TTC37 : Dominio de repetición tetratricopeptídica 37
- UPF0488 : codifica la vía de señalización de la proteína del receptor acoplado a la proteína G
- YIPF5 : Miembro 5 de la familia de dominios Yip1
- YTHDC2 : proteína codificante del dominio YTH que contiene 2
- ZBED3 : proteína 3 que contiene el dominio BED con dedo de zinc
- ZNF608 : proteína codificante Proteína de dedo de zinc 608
Enfermedades y trastornos
Las siguientes son algunas de las enfermedades relacionadas con genes ubicados en el cromosoma 5:
Condiciones cromosómicas
Las siguientes afecciones son causadas por cambios en la estructura o el número de copias del cromosoma 5:
- El síndrome del maullido del gato se debe a una deleción del extremo del brazo corto (p) del cromosoma 5. Este cambio cromosómico se escribe como 5p-. Los signos y síntomas del síndrome del maullido del gato probablemente estén relacionados con la pérdida de múltiples genes en esta región. Los investigadores no han identificado todos estos genes ni han determinado cómo su pérdida conduce a las características del trastorno. Sin embargo, han descubierto que una deleción más grande tiende a dar lugar a un retraso mental y un retraso del desarrollo más graves en las personas con síndrome del maullido del gato. [13] [14] [15]
- Los investigadores han definido regiones estrechas del brazo corto del cromosoma 5 que se asocian con características particulares del síndrome del maullido del gato. Una región específica denominada 5p15.3 se asocia con un llanto similar al del gato, y una región cercana denominada 5p15.2 se asocia con retraso mental, cabeza pequeña (microcefalia) y rasgos faciales distintivos.
- La poliposis adenomatosa familiar es causada por una eliminación del gen supresor de tumores APC en el brazo largo (q) del cromosoma 5. Este cambio cromosómico produce miles de pólipos colónicos, lo que le da al paciente un riesgo del 100 % de padecer cáncer de colon si no se realiza una colectomía total.
- El síndrome de deleción del cromosoma 5q es causado por la eliminación del brazo q (brazo largo) del cromosoma 5. Esta deleción se ha relacionado con varios trastornos relacionados con la sangre, incluidos el síndrome mielodisplásico y la eritroblastopenia . Se trata de una afección diferente del síndrome del maullido del gato, que se mencionó anteriormente.
- Otros cambios en la cantidad o la estructura del cromosoma 5 pueden tener diversos efectos, entre ellos, retraso en el crecimiento y el desarrollo, rasgos faciales distintivos, defectos congénitos y otros problemas médicos. Los cambios en el cromosoma 5 incluyen un segmento adicional del brazo corto (p) o largo (q) del cromosoma en cada célula (trisomía parcial 5p o 5q), un segmento faltante del brazo largo del cromosoma en cada célula (monosomía parcial 5q) y una estructura circular llamada cromosoma 5 en anillo. Un cromosoma en anillo se produce cuando se reúnen ambos extremos de un cromosoma roto.
Banda citogenética
Referencias
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Lectura adicional
- Mainardi PC, Perfumo C, Cali A, Coucourde G, Pastore G, Cavani S, et al. (2001). "Caracterización clínica y molecular de 80 pacientes con deleción 5p: correlación genotipo-fenotipo". J Med Genet . 38 (3): 151–8. doi :10.1136/jmg.38.3.151. PMC 1734829 . PMID 11238681.
- Schafer IA, Robin NH, Posch JJ, Clark BA, Izumo S, Schwartz S (2001). "Síndrome de deleción distal 5q: correlaciones fenotípicas". Am J Med Genet . 103 (1): 63–8. doi :10.1002/ajmg.1513. PMID 11562936.
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Enlaces externos
Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Cromosoma humano 5 .
- Institutos Nacionales de Salud. «Cromosoma 5». Genetics Home Reference . Archivado desde el original el 14 de octubre de 2004. Consultado el 6 de mayo de 2017 .
- «Cromosoma 5». Archivo de información del Proyecto Genoma Humano 1990–2003 . Consultado el 6 de mayo de 2017 .