Complementó sus estudios sobre la región con investigaciones sobre etnología, lingüística, ecología y zoología.

Se matriculó en la Universidad de Harvard en la que obtuvo su doctorado en 1942.

A los 21 años, ya había publicado cinco artículos científicos, principalmente sobre los jeroglíficos mayas.

Él fue quien afirmó por primera vez que este sitio arqueológico era un gran centro urbano maya y no un conjunto de yacimientos en una zona arqueológica extensa como se pensaba originalmente.

La bibliografía de Andrews compilada por Robert Wauchope y Joann Andrews, su tercera esposa, comprende 55 trabajos, en adición a los reportes de los sitios que exploró.