Su sede principal se encuentra en el Palacio Bo en la ciudad de Padua.
Desde 1595, el famoso Anfiteatro anatómico de Padua atrajo a artistas y los científicos que estudiaban el cuerpo humano durante las disecciones públicas.
El anatomista Andreas Vesalius en 1543 publicó De Humani Corporis Fabrica.
El libro provocó gran interés público en disecciones y causó que otras ciudades europeas establecieran teatros anatómicos.
La Universidad ofrece una larga gama de títulos en trece facultades: