Carter decidió hacer un largometraje para explorar la mitología del programa en una escala más amplia, además de atraer a los no fanáticos.
Carter reunió al elenco y al equipo del programa, así como a otros actores conocidos como Blythe Danner y Martin Landau, para comenzar la producción de lo que denominaron «Project Blackwood».
Una secuela, titulada I Want to Believe, fue estrenada diez años después.
Mientras tanto, los agentes especiales del FBI, Fox Mulder y Dana Scully, investigan una amenaza de bomba contra un edificio federal en Dallas, descubren la bomba en un edificio al otro lado de la calle.
Más tarde, el organismo alienígena se gesta inesperadamente y mata a Bronschweig.
Mulder y Scully viajan a la escena del crimen en Texas, donde descubren que el sitio se ha convertido apresuradamente en un nuevo patio de recreo y se encuentran con los niños cuyo amigo cayó al hoyo.
Scully llega al apartamento de Mulder para decirle que la han transferido a Salt Lake City.
En la Antártida, 48 horas después, Mulder encuentra a Scully en una gran instalación subterránea que contiene muchos humanos suspendidos en recintos similares al hielo.
Afuera, Mulder lee un artículo que ha cubierto los domos y el campo de cultivo en Texas.
[10] Carter y Frank Spotnitz escribieron la mayor parte del guion en Hawái durante la Navidad de 1996.
Usaron el mismo método que habían usado al escribir episodios y esbozar escenas para la serie en tarjetas de 3x5.
A su regreso de Hawái, Carter buscó tiempo libre para escribir el guion.
[12] Durante la producción, los realizadores hicieron todo lo posible para preservar el secreto, incluida la impresión del guion en papel rojo para evitar fotocopias,[10] y la filtración de desinformación a los medios y dando a la película el nombre en clave «Project Blackwood».
Sackheim contrató al productor ejecutivo Lata Ryan, quien previamente había colaborado con Steven Spielberg para su película de 1993, Jurassic Park.
En este momento, la mayoría de los miembros del personal no habían leído el guion por sí mismos.
Según Ryan, habían asegurado a todo el personal clave seis semanas antes de que comenzara la filmación principal.
El fichaje de estos actores rompió con lo que se había convertido en tradición para The X-Files.
Carter había elegido a propósito actores virtualmente desconocidos para la serie de televisión, para hacerla más creíble; "Tan pronto como pones a un actor cuyo rostro es muy reconocible, tienes una situación que va en contra de la realidad del programa".
Según Sackheim, Nowak fue contratado porque era el único capaz de crear una "visión enfocada" para la película.
Quería crear un "ambiente oscuro, aterrador y opresivo" para los personajes, especialmente Mulder.
Si bien estaba familiarizado con la serie de televisión, Nowak decidió no revisar ningún episodio como preparación para su papel en la producción.
Al explicar esta decisión, dijo: "Quería que la película fuera lo más fresca y nueva posible en su diseño.
La obra de arte completa se presentó a Chris Carter, Rob Bowman, Lata Ryan y Sackheim para su aprobación.
Al considerar el cronograma, no hicieron cambios notables en la obra de arte.
[17] Carter y Bowman querían filmar en tantos lugares diferentes como fuera posible para darle a la película una sensación "más grandiosa" de la que normalmente se había logrado en los episodios de televisión.
[18] La película se filmó en la pausa entre la cuarta y la quinta temporada del programa y se realizaron nuevas grabaciones durante el rodaje de la quinta temporada del programa.
[27] En 2008, el productor Frank Spotnitz anunció planes para lanzar una nueva edición especial en DVD y Blu-ray de la película.
[30] La película recaudó $83,898,313 en los Estados Unidos y $105,278,110 internacionalmente, lo que arroja un total bruto mundial de $189,176,423.
[42] Andrew Johnston le dio una reseña a la película en Time Out New York y observó: "The X-Files siempre ha sido el programa más cinematográfico de la televisión, y Bowman (que ha dirigido muchos de sus mejores episodios) amplía la escala y el impacto del programa en la pantalla grande mientras manteniendo intactos sus encantos".