Era un hijo del emperador bizantino Andrónico II Paleólogo y de su segunda esposa Yolanda de Montferrato[1]​ y por lo tanto hermano de padre del coemperador Miguel IX Paleólogo.

En octubre de 1307, se casó con una dama genovesa, Argentina Spinola,[2]​ hija del capitán del pueblo y capitán perpetuo de esa república, Opizzino Spinola, y de su esposa Violante di Saluzzo.

Tuvieron dos hijos: Además, tuvo otro hijo, también llamado Juan (1312-1345), que murió en la batalla de Gamenario luchando contra el Reino de Nápoles.

En los parlamentos se debatía la gestión de la tierra y la defensa militar.

Esta forma de gobierno también fue utilizada por otros marqueses de la dinastía Paleólogo para mantener bajo control a la baja nobleza feudal.