La temporada 1969 del Campeonato Europeo de Fórmula Dos fue la tercera edición de dicho campeonato.
Por cada carrera se otorgaron puntos: 9 puntos para el ganador, 6 para el segundo lugar, 4 para el tercer lugar, 3 para el cuarto lugar, 2 para el quinto lugar y 1 para el sexto lugar.
No se otorgaron puntos adicionales.